More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07790 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_07790  predicted permease  100 
 
 		 492 aa  995    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  45.97 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05090  predicted permease  38.42 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.114877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  25.55 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  26.44 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.73 
 
 		 343 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  28.05 
 
 		 405 aa  103  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.2 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  21.89 
 
 		 345 aa  98.2  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 		 373 aa  97.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  27.39 
 
 		 529 aa  97.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  27.31 
 
 		 542 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.95 
 
 		 402 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.95 
 
 		 402 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  26.46 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  22.51 
 
 		 361 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  22.83 
 
 		 373 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  22.19 
 
 		 354 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.42 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  22.79 
 
 		 361 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  22.79 
 
 		 361 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  22.54 
 
 		 361 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  22.79 
 
 		 361 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  22.54 
 
 		 361 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  22.85 
 
 		 355 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  22.79 
 
 		 348 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  22.85 
 
 		 355 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  24.06 
 
 		 392 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  22.82 
 
 		 361 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  22.82 
 
 		 348 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.44 
 
 		 355 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.44 
 
 		 355 aa  90.5  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.44 
 
 		 355 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.44 
 
 		 355 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.44 
 
 		 355 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.85 
 
 		 355 aa  90.1  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.15 
 
 		 361 aa  90.1  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  21.16 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.46 
 
 		 349 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 417 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  24.93 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 		 399 aa  86.7  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.75 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  22.25 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  26.71 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  26.96 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  25.84 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  24.78 
 
 		 362 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 		 392 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  27.49 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  22.41 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  25.75 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.88 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.89 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  28.51 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  27.54 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  22.55 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  24.07 
 
 		 370 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  19.88 
 
 		 351 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  24.62 
 
 		 424 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  25.91 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.32 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  23.1 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  21.66 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  24.49 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  22.57 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  23.72 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  24.34 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  25.91 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  21.75 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  21.65 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  23.14 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.1 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  23.63 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  25.11 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  23.75 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  20.98 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  26.43 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  28.05 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  23.75 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  25.66 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  22.13 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.87 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  25.36 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  25.66 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  28.22 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  23.75 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  23.75 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  25.24 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  27.36 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  23.75 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  24.79 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  23.12 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  24.52 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  21.79 
 
 		 388 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  23.91 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.38 
 
 		 354 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  26.69 
 
 		 376 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>