101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0364 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 473 aa  981    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  31.57 
 
 		 455 aa  200  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  27.22 
 
 		 925 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  27.55 
 
 		 815 aa  146  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  25.21 
 
 		 813 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  25.21 
 
 		 813 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  25.27 
 
 		 785 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  22.09 
 
 		 998 aa  127  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  24.34 
 
 		 971 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  24.89 
 
 		 768 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  24.79 
 
 		 794 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  25.4 
 
 		 796 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  26.7 
 
 		 479 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  23.76 
 
 		 809 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  23.76 
 
 		 809 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  28.02 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  25.83 
 
 		 784 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  27.73 
 
 		 479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  24.42 
 
 		 786 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  23.66 
 
 		 795 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  27.27 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  25.27 
 
 		 788 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  23.14 
 
 		 796 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  23.78 
 
 		 778 aa  107  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  23.78 
 
 		 799 aa  106  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  22.06 
 
 		 920 aa  106  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  25.21 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  25.21 
 
 		 485 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  24.26 
 
 		 463 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  26.16 
 
 		 630 aa  75.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  32.74 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  32.93 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  32.16 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  27.57 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  28.4 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  25.1 
 
 		 650 aa  67.8  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  26.49 
 
 		 666 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  29.56 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  23.32 
 
 		 654 aa  67.4  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  24.69 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  27.22 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  26.95 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  36.11 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  24.77 
 
 		 647 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  27.81 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  30.67 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  25.75 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  26.92 
 
 		 652 aa  60.8  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  26.27 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  26.82 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  27.64 
 
 		 531 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  28.48 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.31 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  28.99 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  24.61 
 
 		 590 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  27.38 
 
 		 630 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  25.09 
 
 		 549 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  28.37 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  23.08 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.24 
 
 		 548 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  26.63 
 
 		 658 aa  53.9  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  22.62 
 
 		 590 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  25.84 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  26.27 
 
 		 546 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  28.37 
 
 		 509 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  25.29 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  23.85 
 
 		 517 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  24.44 
 
 		 549 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  23.74 
 
 		 548 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  24.81 
 
 		 542 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  25.14 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  26.91 
 
 		 558 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  26.29 
 
 		 551 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  26.36 
 
 		 548 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  27.47 
 
 		 558 aa  50.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  31.39 
 
 		 886 aa  50.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  24.12 
 
 		 866 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  27.23 
 
 		 548 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  26.37 
 
 		 558 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  27.71 
 
 		 470 aa  47  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  24.89 
 
 		 564 aa  47  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  25.11 
 
 		 548 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  25.77 
 
 		 548 aa  46.6  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  25.76 
 
 		 979 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  26.62 
 
 		 1042 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0358  type III restriction protein res subunit  23.77 
 
 		 843 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  26.22 
 
 		 548 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  23.14 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  24.5 
 
 		 967 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  26.43 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  25.58 
 
 		 554 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  26.09 
 
 		 561 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  23.84 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  22.88 
 
 		 773 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.26 
 
 		 555 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 550 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  26.99 
 
 		 550 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  25.96 
 
 		 602 aa  43.5  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>