282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0289 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0289  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 502 aa  1029    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3960  Sel1 domain-containing protein  55.38 
 
 		 473 aa  545  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3592  Sel1 domain-containing protein  53.98 
 
 		 472 aa  542  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0572167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3827  Sel1 domain-containing protein  55.09 
 
 		 485 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4276  Sel1 domain-containing protein  55.09 
 
 		 491 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4143  Sel1 domain-containing protein  54.89 
 
 		 491 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0191  Sel1 domain-containing protein  54.69 
 
 		 491 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0321  Sel1 domain-containing protein  53.98 
 
 		 484 aa  534  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.845826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3754  Sel1 domain-containing protein  55.49 
 
 		 485 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0192  Sel1 domain protein repeat-containing protein  54.69 
 
 		 491 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3952  Sel1 domain-containing protein  54.8 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4559  hypothetical protein  55.25 
 
 		 484 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0250  Sel1 domain-containing protein  52.99 
 
 		 472 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0249  Sel1 domain-containing protein  54.18 
 
 		 471 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0389446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3451  hypothetical protein  44 
 
 		 475 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  25.28 
 
 		 544 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  34.91 
 
 		 536 aa  77  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.06 
 
 		 684 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.81 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  30.45 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 1032 aa  70.9  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  36.28 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  36.28 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  36.28 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  36.28 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1402 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.12 
 
 		 1037 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1877 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.42 
 
 		 1263 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.4 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.36 
 
 		 528 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  29.63 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  31.69 
 
 		 817 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.43 
 
 		 831 aa  68.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.08 
 
 		 865 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1493 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.91 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  30.82 
 
 		 246 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.68 
 
 		 346 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.27 
 
 		 789 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  27.51 
 
 		 961 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  35.65 
 
 		 218 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.68 
 
 		 2413 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.52 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  31.05 
 
 		 680 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.92 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.67 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  37.61 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  37.61 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  27.5 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 1196 aa  63.5  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.32 
 
 		 235 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.57 
 
 		 1260 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  32.34 
 
 		 380 aa  63.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  27.96 
 
 		 978 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.82 
 
 		 1072 aa  63.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  26.44 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  25.08 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  25.4 
 
 		 685 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.04 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.07 
 
 		 1261 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 181 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.88 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  23.94 
 
 		 1003 aa  61.6  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.52 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.61 
 
 		 1110 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 976 aa  61.6  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  31.94 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  32.65 
 
 		 1059 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.51 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  27.55 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  30.59 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  28.04 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.7 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.08 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.67 
 
 		 997 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81785  chitin synthase regulatory factor  34.65 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.757769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.48 
 
 		 255 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.77 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  32.8 
 
 		 913 aa  59.3  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  27.27 
 
 		 1200 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  28.65 
 
 		 591 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  30.25 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  30.96 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  33.95 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1290  hypothetical protein  29.88 
 
 		 1602 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.450967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  30.41 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2296  Sel1 domain-containing protein  27.88 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  34.15 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.03 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  26.67 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  39.24 
 
 		 850 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1160 aa  57.4  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.01 
 
 		 565 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  30.36 
 
 		 839 aa  57  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>