More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3487 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  78.25 
 
 		 435 aa  667    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  82.22 
 
 		 471 aa  712    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  82.22 
 
 		 471 aa  711    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 435 aa  882    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  82.22 
 
 		 465 aa  711    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  84.19 
 
 		 465 aa  742    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  86.75 
 
 		 465 aa  728    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  84.06 
 
 		 437 aa  746    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  83.64 
 
 		 466 aa  733    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  82.76 
 
 		 470 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  61.37 
 
 		 439 aa  505  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  59.91 
 
 		 431 aa  495  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  58.64 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  51.27 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  50.7 
 
 		 480 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  51.67 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  53.81 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  45.69 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  51.88 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  47.82 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  49 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  46.52 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  45.69 
 
 		 431 aa  339  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.9 
 
 		 401 aa  311  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  43.68 
 
 		 393 aa  302  8.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  40.56 
 
 		 390 aa  300  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  40.3 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  42.49 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  40.45 
 
 		 400 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  41.75 
 
 		 410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  39.59 
 
 		 399 aa  282  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  39.95 
 
 		 399 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  38.5 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  39.95 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  38.27 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  40.2 
 
 		 411 aa  279  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  41.25 
 
 		 389 aa  279  9e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.62 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  38.97 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  38.04 
 
 		 391 aa  276  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  38.97 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  39.69 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  38.25 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  37.98 
 
 		 404 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  38.77 
 
 		 398 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  38.77 
 
 		 398 aa  274  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  39.85 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  39.8 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  42.59 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  38.78 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  40.4 
 
 		 380 aa  270  5e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  36.69 
 
 		 405 aa  269  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  40 
 
 		 410 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  38.4 
 
 		 407 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  39.05 
 
 		 384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  35.29 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  35.29 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  37.88 
 
 		 390 aa  266  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  41.69 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  37.08 
 
 		 405 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  41.33 
 
 		 454 aa  262  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  38 
 
 		 405 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  38.87 
 
 		 397 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  37.15 
 
 		 405 aa  262  8.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  37.38 
 
 		 387 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  37.84 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  36.71 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  37.81 
 
 		 389 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  38.5 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  36.99 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  40.31 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  36.52 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  39.09 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  37.75 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  37.75 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  36.1 
 
 		 408 aa  260  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  38.68 
 
 		 401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  41.97 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.44 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  38.56 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  37.34 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  37.19 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  38.64 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  38.38 
 
 		 381 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  38.15 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  38.12 
 
 		 398 aa  257  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  38 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  36.5 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  37.66 
 
 		 381 aa  256  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  38.33 
 
 		 397 aa  256  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  37.28 
 
 		 388 aa  256  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  38.9 
 
 		 386 aa  256  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3623  amidohydrolase  38.36 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  39.59 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  37.14 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  37.53 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  40.68 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  38.85 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  36.5 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  37.82 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>