61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3581 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 323 aa  661    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  31.08 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  33.11 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  34.25 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  32.42 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  31.13 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  30.5 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  30.32 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  28.99 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  32.11 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  27.89 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  29.47 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  29.47 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1411  general secretion pathway protein C  30.36 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  29.15 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  29.15 
 
 		 309 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  27.65 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  27.65 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  28.08 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  27.33 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  26.28 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  25.91 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  26.13 
 
 		 308 aa  95.9  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  27.89 
 
 		 277 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  29.81 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  25.67 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  28.28 
 
 		 328 aa  92.4  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  30.71 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  27.3 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2861  general secretion pathway protein C  32.84 
 
 		 287 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  27.86 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  29.23 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  28.77 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  28.52 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  28.52 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  27.19 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0726  general secretion pathway protein C  29.69 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  26.19 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0002  general secretion pathway protein C  26.58 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.856958  normal  0.237385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.8 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  27.23 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0249  hypothetical protein  23.41 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00883556  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0389  general secretion pathway protein C  22.5 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000776949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03126  hypothetical protein  22.5 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.013931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03175  general secretory pathway component, cryptic  22.5 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0389  general secretion pathway protein C  22.5 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125631  normal  0.017456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3518  general secretion pathway protein C  22.5 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000156607  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  25.55 
 
 		 282 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  24.44 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2376  general secretion pathway protein C  28.39 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0611  type II secretory pathway component PulC-like protein  26.14 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78694e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0597  type II secretory pathway component PulC-like protein  26.14 
 
 		 296 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  25.74 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3363  PDZ/DHR/GLGF  32.39 
 
 		 290 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000344087  hitchhiker  0.00365094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1282  type II secretory pathway component PulC-like protein  30.77 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2654  type II secretion system protein C  24.74 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  33.33 
 
 		 513 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  35.19 
 
 		 516 aa  43.5  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  31.58 
 
 		 463 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0330  general secretion pathway protein C, putative  28.79 
 
 		 291 aa  42.7  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70188  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  34.55 
 
 		 456 aa  42.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>