158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0544 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  99.16 
 
 
237 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  99.16 
 
 
237 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  99.16 
 
 
237 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  97.89 
 
 
237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  89.45 
 
 
236 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  89.45 
 
 
236 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  89.45 
 
 
236 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  86.55 
 
 
237 aa  407  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  65.13 
 
 
256 aa  315  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  63.71 
 
 
234 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  61.18 
 
 
236 aa  297  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  58.44 
 
 
241 aa  275  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  55.23 
 
 
238 aa  260  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  49.37 
 
 
235 aa  224  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3168  hypothetical protein  50.63 
 
 
238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  45.61 
 
 
231 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  47.64 
 
 
230 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  45.73 
 
 
231 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  45.75 
 
 
238 aa  184  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  38.39 
 
 
246 aa  141  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  38.71 
 
 
246 aa  141  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  38.18 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  34.85 
 
 
242 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  36.97 
 
 
251 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  38.12 
 
 
242 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  37.62 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  37.62 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  37.62 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  37.62 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  37.62 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  37.62 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  37.62 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  37.62 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  37.62 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  32.64 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  32.64 
 
 
259 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  36.06 
 
 
248 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  32.23 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  36.06 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  36.06 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  36.06 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  36.06 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0373  hypothetical protein  30.8 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  31.13 
 
 
251 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  34.24 
 
 
240 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  33.95 
 
 
242 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  30.81 
 
 
246 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3310  hypothetical protein  32.29 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  34.1 
 
 
239 aa  95.5  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  32.14 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  29.58 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  29.58 
 
 
234 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  33.15 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  31.61 
 
 
245 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  29.33 
 
 
241 aa  92  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  32.4 
 
 
236 aa  92  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0141  protein of unknown function DUF541  32.96 
 
 
202 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  30.48 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  29.44 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  30.8 
 
 
243 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  31.51 
 
 
232 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  33.95 
 
 
281 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  28.87 
 
 
245 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  31.48 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  28.57 
 
 
251 aa  85.1  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  31.25 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  31.37 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  30.85 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  31.86 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  29.56 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  29.22 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  26.56 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  28.31 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  30 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  29.13 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  27.75 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  30.67 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  28.63 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  28.63 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  27.49 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  27.43 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  29.19 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  28.44 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  31.62 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01998  putative periplasmic immunogenic protein  33.51 
 
 
190 aa  72  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0383413  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  27.61 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  27.59 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  26.92 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  28.18 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  28.16 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  27.31 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  27.1 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  22.27 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3934  protein of unknown function DUF541  23.97 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  27.23 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  25.62 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  31.36 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  30.06 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  27.92 
 
 
254 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>