More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4257 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  75.74 
 
 		 435 aa  681    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  95.54 
 
 		 471 aa  885    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  95.33 
 
 		 471 aa  884    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  94.9 
 
 		 466 aa  890    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  82.22 
 
 		 435 aa  689    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  100 
 
 		 465 aa  945    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  88.79 
 
 		 465 aa  832    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  89.01 
 
 		 465 aa  805    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  80.73 
 
 		 437 aa  726    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  90.49 
 
 		 470 aa  822    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  60.92 
 
 		 439 aa  501  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  57.86 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  59.01 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  53.11 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  53.33 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  52.49 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  53.09 
 
 		 459 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  47.93 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  50.23 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  46.01 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  49.14 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  46.14 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  43.32 
 
 		 431 aa  321  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.51 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  40.87 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  42.71 
 
 		 393 aa  293  7e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  40.35 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  41.52 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  40.8 
 
 		 400 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  40.1 
 
 		 395 aa  286  7e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  40.61 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  39.8 
 
 		 411 aa  282  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  40.64 
 
 		 399 aa  279  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  38.67 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.71 
 
 		 391 aa  275  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  38.74 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  42.11 
 
 		 380 aa  273  5.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  40.73 
 
 		 389 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  39.65 
 
 		 408 aa  273  6e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  39.38 
 
 		 407 aa  272  9e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  40 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.06 
 
 		 405 aa  269  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  37.56 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  38.38 
 
 		 405 aa  268  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  37.5 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  37.71 
 
 		 395 aa  266  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  37.81 
 
 		 405 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  38.9 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  38.07 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.17 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  38.65 
 
 		 388 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  38.77 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  38.24 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  37.25 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  38.42 
 
 		 388 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  37.66 
 
 		 398 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  37.71 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  39.12 
 
 		 410 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  38.92 
 
 		 394 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.63 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  36.18 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  36.18 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  42.63 
 
 		 399 aa  260  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  41.32 
 
 		 454 aa  259  7e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  36.59 
 
 		 415 aa  259  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  36.9 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  39.05 
 
 		 417 aa  257  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  37.72 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  37.97 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  40 
 
 		 397 aa  257  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  38.19 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  40.81 
 
 		 403 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3623  amidohydrolase  38.37 
 
 		 399 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  39.01 
 
 		 390 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  37 
 
 		 387 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.76 
 
 		 379 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  37 
 
 		 387 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  36.91 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  37.09 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  37.53 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  38.86 
 
 		 399 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  37 
 
 		 402 aa  253  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  36.3 
 
 		 397 aa  253  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.28 
 
 		 394 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  36.91 
 
 		 387 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  38.35 
 
 		 386 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  35.63 
 
 		 391 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  37.84 
 
 		 392 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  38.7 
 
 		 388 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  37.16 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  38.11 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  38.38 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  37.09 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  36.5 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  38.82 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  36.41 
 
 		 389 aa  250  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.66 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  36.93 
 
 		 400 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  36.05 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>