More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3088 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 956 aa  1912    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  54.69 
 
 		 1046 aa  771    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.96 
 
 		 960 aa  717    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  61.46 
 
 		 973 aa  1116    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  45.88 
 
 		 937 aa  689    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  39.59 
 
 		 945 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  36.45 
 
 		 954 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  33.64 
 
 		 952 aa  439  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  33.64 
 
 		 952 aa  439  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  32.72 
 
 		 952 aa  436  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  33.41 
 
 		 952 aa  435  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  31.92 
 
 		 982 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  32.14 
 
 		 919 aa  198  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  27.35 
 
 		 1038 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.22 
 
 		 1057 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.74 
 
 		 1201 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.74 
 
 		 1201 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.11 
 
 		 1046 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  30.37 
 
 		 1082 aa  178  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.66 
 
 		 1028 aa  178  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  28.49 
 
 		 1031 aa  175  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.17 
 
 		 1045 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.97 
 
 		 971 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  25.08 
 
 		 969 aa  174  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.11 
 
 		 952 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  26.97 
 
 		 988 aa  171  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  28.05 
 
 		 1165 aa  170  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  28.59 
 
 		 1044 aa  164  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  27.34 
 
 		 1058 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  27.76 
 
 		 941 aa  159  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  27.76 
 
 		 941 aa  159  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  28.05 
 
 		 949 aa  157  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.92 
 
 		 584 aa  154  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.06 
 
 		 966 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  26.91 
 
 		 972 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  26.29 
 
 		 958 aa  152  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  30.28 
 
 		 578 aa  151  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.78 
 
 		 584 aa  151  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  34.81 
 
 		 1094 aa  150  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  25.62 
 
 		 560 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  30.15 
 
 		 940 aa  148  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  25.63 
 
 		 958 aa  148  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  28.97 
 
 		 923 aa  147  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  27.8 
 
 		 1170 aa  147  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.59 
 
 		 1013 aa  147  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  26.8 
 
 		 969 aa  146  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  24.91 
 
 		 560 aa  145  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  24.91 
 
 		 560 aa  145  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  26.47 
 
 		 957 aa  145  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  25.17 
 
 		 1170 aa  144  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  28.3 
 
 		 919 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  28.34 
 
 		 953 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  24.34 
 
 		 560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  24.72 
 
 		 560 aa  142  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  24.72 
 
 		 560 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  24.72 
 
 		 560 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  24.72 
 
 		 560 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  24.72 
 
 		 560 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  24.72 
 
 		 560 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  24.53 
 
 		 560 aa  141  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  25.21 
 
 		 877 aa  141  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  29.27 
 
 		 1069 aa  141  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  29.27 
 
 		 1069 aa  141  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  26.7 
 
 		 933 aa  139  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  27.63 
 
 		 962 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  26.92 
 
 		 1167 aa  137  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  24.08 
 
 		 555 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.39 
 
 		 572 aa  134  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  26.6 
 
 		 941 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.87 
 
 		 801 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  27.14 
 
 		 669 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.81 
 
 		 805 aa  131  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  26.15 
 
 		 950 aa  127  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  24.4 
 
 		 554 aa  124  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  26.96 
 
 		 933 aa  123  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  28.28 
 
 		 969 aa  119  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  28.51 
 
 		 967 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  28.51 
 
 		 967 aa  112  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  24.51 
 
 		 467 aa  111  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.18 
 
 		 1095 aa  111  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  26.13 
 
 		 900 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  26.73 
 
 		 968 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  27.19 
 
 		 958 aa  108  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  26.19 
 
 		 968 aa  108  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  25.76 
 
 		 958 aa  107  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  31.01 
 
 		 933 aa  107  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  31.31 
 
 		 953 aa  106  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  34.13 
 
 		 1049 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  25.1 
 
 		 1138 aa  105  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  26.84 
 
 		 964 aa  105  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  26.69 
 
 		 942 aa  104  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  35.55 
 
 		 1170 aa  104  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  34.86 
 
 		 440 aa  104  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  37.75 
 
 		 1194 aa  104  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  35.44 
 
 		 1177 aa  104  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  31.42 
 
 		 946 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  30.87 
 
 		 948 aa  104  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  26.29 
 
 		 894 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  33.81 
 
 		 1168 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0832  DEAD-like helicases-like  32.87 
 
 		 313 aa  103  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>