198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2943 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
193 aa  390  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.74 
 
 
197 aa  193  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.48 
 
 
199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  46.43 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  46.07 
 
 
194 aa  148  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  43.68 
 
 
194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  42.11 
 
 
193 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  40.53 
 
 
193 aa  107  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40.2 
 
 
215 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.23 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.75 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.44 
 
 
218 aa  94.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  34.38 
 
 
180 aa  94.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 
182 aa  91.3  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.26 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.19 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  40.28 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.82 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.81 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.36 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.86 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
180 aa  79  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  37.97 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  34.51 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.9 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.56 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  31.73 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.03 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  28.9 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.75 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  31.63 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.36 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.36 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.47 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  28.43 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.73 
 
 
219 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.51 
 
 
220 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  27.54 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.34 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.02 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.42 
 
 
188 aa  61.6  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  29.41 
 
 
215 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  28.88 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  29.94 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  28.37 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  28.27 
 
 
216 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  28.27 
 
 
216 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  28.27 
 
 
216 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  34.17 
 
 
216 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.54 
 
 
218 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 
190 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  30.3 
 
 
177 aa  58.9  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  24.47 
 
 
174 aa  58.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  30.95 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  25.96 
 
 
217 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  30.93 
 
 
199 aa  58.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.8 
 
 
189 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.27 
 
 
214 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.04 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  31.62 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  27.23 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  28.92 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  25.93 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.13 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.35 
 
 
201 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.33 
 
 
206 aa  55.1  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.15 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  28.93 
 
 
186 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.04 
 
 
213 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.5 
 
 
224 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.3 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  26.04 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  29.29 
 
 
227 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.01 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.61 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  27.97 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  28.19 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  29.82 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  25.62 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.54 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.23 
 
 
201 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  32.71 
 
 
214 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  30.57 
 
 
173 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.7 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  25.84 
 
 
228 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  25.89 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  28.74 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  27.23 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>