More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2435 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  100 
 
 		 293 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  68.94 
 
 		 293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  67.58 
 
 		 293 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  68.6 
 
 		 293 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  67.58 
 
 		 293 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  67.58 
 
 		 293 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  67.58 
 
 		 293 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  66.89 
 
 		 293 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  67.58 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  67.92 
 
 		 293 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  67.58 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  66.89 
 
 		 293 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  67.58 
 
 		 293 aa  377  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  67.24 
 
 		 293 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  67.58 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2570  polyprenyl synthetase  64.51 
 
 		 293 aa  353  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0334175  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  56.27 
 
 		 294 aa  321  8e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  59.79 
 
 		 294 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2239  geranyltranstransferase  57.84 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1089  geranyltranstransferase  57.09 
 
 		 300 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01174  geranyltranstransferase  57.61 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  52.9 
 
 		 298 aa  290  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1320  polyprenyl synthetase  55.44 
 
 		 296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  55.02 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01426  geranyltranstransferase  55.59 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.631666  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  57.53 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  57.53 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  57.53 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  57.19 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  57.19 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  50.52 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3111  geranyltranstransferase  56.08 
 
 		 306 aa  265  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3252  geranyltranstransferase  56.08 
 
 		 306 aa  265  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  54.28 
 
 		 306 aa  265  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3073  geranyltranstransferase  55.74 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  55.89 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  54.98 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  55.36 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  55.36 
 
 		 299 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  55.36 
 
 		 299 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3084  geranyltranstransferase  54.76 
 
 		 303 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  55.36 
 
 		 299 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  55.36 
 
 		 299 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  55.36 
 
 		 299 aa  261  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  55.02 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  55.02 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1031  geranyltranstransferase  54.27 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1079  geranyltranstransferase  56.1 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  55.16 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  54.8 
 
 		 291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3280  geranyltranstransferase  54.27 
 
 		 303 aa  252  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  54.1 
 
 		 299 aa  251  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  47.89 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  50.34 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0274  geranyltranstransferase  48.44 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  53.41 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  53.41 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  48.75 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  54.01 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  51.57 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2893  geranyltranstransferase  52.41 
 
 		 303 aa  241  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  50.55 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  51.75 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  51.67 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  48.75 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  48.4 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  48.75 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  51.23 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  47.69 
 
 		 294 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  47.69 
 
 		 294 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  47.69 
 
 		 294 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  51.28 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  46.85 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  51.57 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  46.85 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  47.33 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  51.56 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1146  polyprenyl synthetase  54.23 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  42.27 
 
 		 290 aa  232  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  50.18 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  52.41 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  45.55 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  46.64 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  52.41 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  45.17 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1388  polyprenyl synthetase  47.77 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  50.68 
 
 		 295 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  51.01 
 
 		 295 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  47.16 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  47.16 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  47.16 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  47.16 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  45.1 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  48.66 
 
 		 303 aa  228  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  47.33 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  47.33 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  49.65 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  47.33 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  43.2 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>