299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1415 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 288 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  60.69 
 
 		 292 aa  361  8e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  59.78 
 
 		 289 aa  352  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  58.18 
 
 		 291 aa  349  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  60.52 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  58.09 
 
 		 287 aa  340  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  54.09 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  53.74 
 
 		 296 aa  299  4e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  45.65 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  40.6 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  37.68 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  36.42 
 
 		 329 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  29.45 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  28.32 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  29.23 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.5 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  26.81 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  24.61 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  24.92 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  27.56 
 
 		 644 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.34 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  26.17 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  26.17 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.57 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.62 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  24.21 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  24.81 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  26.26 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  28.49 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  27.59 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  25.66 
 
 		 637 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25.81 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  28.76 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  26.14 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.35 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  25.22 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  26.92 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  26.92 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3152  Beta-lactamase  26.8 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  25.59 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  23.98 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.21 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  23.77 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  30.87 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  22.97 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.85 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  30.2 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  23.7 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>