More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2492 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 242 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  62.72 
 
 		 300 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  57 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  55.2 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  54.59 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  49.79 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  62.5 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  49.38 
 
 		 240 aa  174  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  63.64 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  46.38 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  60.49 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  51.58 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  51.01 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  51.01 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  50.98 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  47.27 
 
 		 310 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  59.35 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  56.25 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  62.5 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  51 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  44.4 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  55.26 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  51 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  58.4 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  50.25 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  50.87 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  51.9 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  46.04 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  47.17 
 
 		 265 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  54.25 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  57.81 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  47.24 
 
 		 338 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  48.43 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  48.48 
 
 		 460 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  51.18 
 
 		 484 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  56.69 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  47.76 
 
 		 439 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  50.34 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  52.42 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  39.64 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  43.2 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  50.41 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  45.52 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  42.76 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  59.3 
 
 		 120 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  47.93 
 
 		 260 aa  95.1  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  49.22 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  47.5 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  43.06 
 
 		 282 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  47.9 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  44.92 
 
 		 307 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  40.97 
 
 		 340 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  43.7 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 280 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  46.51 
 
 		 202 aa  89.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  44.54 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  44.63 
 
 		 196 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  43.22 
 
 		 328 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  43.22 
 
 		 328 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  42.86 
 
 		 174 aa  85.5  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  41.6 
 
 		 329 aa  85.5  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  44.2 
 
 		 603 aa  85.1  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  49.53 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  38.19 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  48.62 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  45.69 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  42.96 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  42.4 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  48.28 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  42.06 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  39.34 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  41.43 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  42.4 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  45.54 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  40 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  43.8 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  42.62 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  43.22 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  36.92 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  45.6 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  45.74 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  41.41 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  38.19 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  36.15 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  38.17 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  41.32 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  33.51 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  36.15 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  42.15 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  36.15 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  42.62 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>