More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2122 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  590  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0569  LysR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 295 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5155  LysR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 303 aa  281  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  30.59 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  28.14 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 339 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 349 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0814  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.35587  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 363 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2198  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1564  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0603  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2039  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0718  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2111  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.43 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  35.26 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  28.43 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0788  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.84 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 307 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2328  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.475016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3076  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.513194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0183  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5799  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.85 
 
 		 290 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.18 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  32.92 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0357  transcriptional regulator  35.54 
 
 		 286 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.449267  unclonable  0.0000000664485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>