More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0421 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 371 aa  771    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  86.89 
 
 		 369 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  87.5 
 
 		 331 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  68.58 
 
 		 380 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  68.31 
 
 		 380 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  68.03 
 
 		 380 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  68.58 
 
 		 380 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  65.85 
 
 		 367 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  66.39 
 
 		 367 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  70.64 
 
 		 326 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  70.64 
 
 		 326 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  70.34 
 
 		 327 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  70.34 
 
 		 326 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  69.72 
 
 		 326 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  59.94 
 
 		 383 aa  466  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  58.61 
 
 		 368 aa  441  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  54.32 
 
 		 366 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  55.1 
 
 		 365 aa  422  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  57.31 
 
 		 373 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  60.19 
 
 		 332 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  60.12 
 
 		 332 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  59.44 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  53.13 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  52.85 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  51.79 
 
 		 377 aa  411  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  54.42 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  54.42 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  51.62 
 
 		 372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  54.19 
 
 		 367 aa  401  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  53.63 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  56.34 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  52.82 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  56.75 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  56.02 
 
 		 364 aa  389  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  52.23 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  57.54 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  50.69 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  56.89 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  58.2 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  52.49 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  50.27 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  54.94 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  54.14 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  51.79 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  47.88 
 
 		 372 aa  364  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  53.94 
 
 		 340 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  52.98 
 
 		 334 aa  360  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  48.07 
 
 		 371 aa  359  5e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 364 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 326 aa  355  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  51.65 
 
 		 369 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  50.73 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  50.93 
 
 		 329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  53.92 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  44.88 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  47.38 
 
 		 365 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  47.38 
 
 		 375 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2808  LigA  48.47 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.999954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  48.44 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 		 369 aa  345  6e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  53.25 
 
 		 317 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0251  peptide chain release factor 2  53.03 
 
 		 372 aa  344  1e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  46.56 
 
 		 374 aa  343  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  46.96 
 
 		 366 aa  342  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.1 
 
 		 362 aa  342  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1628  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 365 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  46.13 
 
 		 367 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1448  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  46.52 
 
 		 375 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  46.13 
 
 		 367 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  46.74 
 
 		 375 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  47.14 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  45.86 
 
 		 459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1790  peptide chain release factor 2  49.31 
 
 		 365 aa  339  5.9999999999999996e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.801319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  48.84 
 
 		 371 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  46.8 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  45.86 
 
 		 367 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 		 330 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  46.28 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  47.81 
 
 		 354 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 		 371 aa  335  5.999999999999999e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  49.39 
 
 		 343 aa  335  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  47.38 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0259  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0257  peptide chain release factor 2  54.38 
 
 		 333 aa  332  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000258105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  46.01 
 
 		 365 aa  332  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  45.73 
 
 		 365 aa  332  7.000000000000001e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  45.22 
 
 		 361 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  45.28 
 
 		 378 aa  332  9e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  48.12 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  46.28 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 375 aa  331  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  45.53 
 
 		 376 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  44.48 
 
 		 370 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>