182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1528 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1528  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 306 aa  615  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187391  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  32.64 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  28.16 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  26.3 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  26.94 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  32.48 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  29.43 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  25.83 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  26.91 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  30.68 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  30.45 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  26.43 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  30.16 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  26.9 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  29.88 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  28.83 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  23.47 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  23.13 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  29.6 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  28.45 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  35.56 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  26.11 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25.09 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  28.78 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  32.09 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  25.88 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  31.5 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  25.5 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  31.63 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  24.56 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  24.38 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  22.97 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  24.71 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  28.33 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  25.08 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  27.13 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  24.67 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  25.57 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  25.74 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  29.73 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  23.1 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  26.57 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  24.2 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  32.46 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25.45 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  24.66 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  26.64 
 
 		 355 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  24.42 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  27.35 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  25.33 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  25.78 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  26.43 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  26.61 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  32.28 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  28.24 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  24.23 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  27.76 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  26.61 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  25.23 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>