145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3715 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  40.67 
 
 		 382 aa  143  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  41.44 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  38.76 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  34.8 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  35.18 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  33.16 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  31.75 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  39.13 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  34.25 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  36 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  31.89 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  27.72 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  34.41 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  33.01 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  36.5 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  36.46 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  36.19 
 
 		 357 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  35.26 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  34.81 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  37.78 
 
 		 510 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  36.36 
 
 		 225 aa  99.4  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  32.27 
 
 		 254 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  36.27 
 
 		 253 aa  99  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  29.05 
 
 		 250 aa  98.6  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  33 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  31.52 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  32.62 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  31.88 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  34.07 
 
 		 255 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  33.15 
 
 		 508 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  35.14 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  33.15 
 
 		 508 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  34.5 
 
 		 237 aa  91.3  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  31.84 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  35.5 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.34 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  28.08 
 
 		 371 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  36.84 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  34.78 
 
 		 518 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  32.09 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  34.81 
 
 		 523 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  31.43 
 
 		 252 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  31.94 
 
 		 392 aa  89  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  33.69 
 
 		 252 aa  88.6  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  31.94 
 
 		 356 aa  88.2  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  33.71 
 
 		 251 aa  87.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  28.22 
 
 		 510 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  31.36 
 
 		 375 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  35.82 
 
 		 509 aa  87  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  33.97 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  30.23 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  32.12 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  29.74 
 
 		 475 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.84 
 
 		 341 aa  78.6  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  29.65 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  34.02 
 
 		 3021 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  30.6 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  30.82 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.43 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  28.49 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  32.9 
 
 		 551 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  31.89 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  32.32 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  29.94 
 
 		 325 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  35.09 
 
 		 518 aa  71.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  38.71 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  33.95 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  29.51 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  29.94 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  28.8 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  29.94 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  29.94 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  33.15 
 
 		 491 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  30.14 
 
 		 532 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  31.33 
 
 		 1514 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  35.29 
 
 		 492 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  34.76 
 
 		 3002 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  34.01 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  26.6 
 
 		 474 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  28.72 
 
 		 471 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  32.62 
 
 		 564 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3674  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 860 aa  65.1  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 547 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  28.86 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 656 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  32.62 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  32.62 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  33.64 
 
 		 529 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0920  hypothetical protein  28.26 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  30.54 
 
 		 526 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  33.59 
 
 		 602 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.69 
 
 		 461 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  31.55 
 
 		 559 aa  62  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.52 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  31.61 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 		 2454 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  32.02 
 
 		 2706 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  34.46 
 
 		 531 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>