176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0728 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  319  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  319  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  73.46 
 
 		 162 aa  231  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  50.35 
 
 		 265 aa  142  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  54.84 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  53.78 
 
 		 174 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  39.01 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  45.53 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  40.94 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  36.69 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  30.87 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  39.1 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  48.48 
 
 		 204 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  38.96 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  41.67 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  42.5 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  37.12 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  45.45 
 
 		 203 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  39.84 
 
 		 185 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  34.78 
 
 		 138 aa  87.4  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  44.52 
 
 		 191 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  35.67 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  39.57 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  37.82 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  36.09 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  36.09 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  46.46 
 
 		 190 aa  85.1  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  35.34 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  37.04 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  41.53 
 
 		 328 aa  84.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  38.39 
 
 		 175 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  39.32 
 
 		 209 aa  83.6  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  37.19 
 
 		 327 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  35.54 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  35.07 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  37.96 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  35.38 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  37.12 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  41.88 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  42.15 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  43.7 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  35.48 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  45.53 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  34.29 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  41.78 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  38.66 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  38.18 
 
 		 321 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  36.15 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  34.53 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  36.61 
 
 		 338 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  36.36 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  36.75 
 
 		 193 aa  77  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  37.17 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  32.89 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  38.71 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  32.45 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  32.37 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  35.71 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  39.5 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  41.04 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  36.44 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  34.81 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  38.66 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  41.46 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  32.19 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  32.62 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.11 
 
 		 351 aa  74.7  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  36.36 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  38.05 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.11 
 
 		 334 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  32.62 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  37.61 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3578  protein of unknown function DUF461  38.98 
 
 		 206 aa  73.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  34.75 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  36 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  37.67 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  35.77 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  34.23 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  31.91 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  35.2 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  38.97 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  36.05 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3399  hypothetical protein  35.4 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  34.45 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  38.76 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  30.88 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  33.08 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  35.53 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  37.5 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>