216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3237 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3237  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47010  Carbon monoxide oxidation transcription regulator, Crp/Fnr family: CooA  40 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 
220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0800  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.11 
 
 
224 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0302672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3027  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
216 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1089  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
218 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3189  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
219 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2046  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
219 aa  102  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0383  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.87 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.164826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3790  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 
226 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000171716  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1134  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
223 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.972162  normal  0.0613651 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1233  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.65 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0234193  normal  0.501568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
222 aa  85.5  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.18 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.366643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2894  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0602886  normal  0.0128159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4494  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.164578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0880  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.69 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.812688  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.76 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3679  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.54 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.170413  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.93 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1123  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.16 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.06 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.98 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.9 
 
 
254 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  29.33 
 
 
215 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3348  cyclic nucleotide-binding  29.38 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181039  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3232  cyclic nucleotide-binding protein  26.02 
 
 
212 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  25.64 
 
 
211 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  28 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  25.64 
 
 
211 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.45 
 
 
232 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
228 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
224 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.96 
 
 
223 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  25.87 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  25.87 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  25.87 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
218 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.86 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.15 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.67 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  23.71 
 
 
211 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0984  Crp-like transcriptional regulator  25.98 
 
 
209 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.26 
 
 
230 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.87 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 
225 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  26.14 
 
 
214 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.98 
 
 
231 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 
210 aa  55.5  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
225 aa  55.5  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  24.5 
 
 
217 aa  55.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.65 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.65 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.7 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4199  cyclic nucleotide-binding protein  25.31 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.24 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  23.08 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
221 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  24.63 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.88 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.88 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0675  cyclic nucleotide-binding protein  26.7 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.08 
 
 
229 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  24.62 
 
 
211 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1896  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.08 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.97 
 
 
214 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  24.88 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  24.62 
 
 
211 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
223 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
224 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
238 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1887  FNR/CRP family transcriptional regulator  26.78 
 
 
216 aa  53.1  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000504679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>