More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2804 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2804  ABC transporter component  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  62.38 
 
 		 217 aa  290  1e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  62.38 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  62.38 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  61.09 
 
 		 238 aa  284  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  61.54 
 
 		 238 aa  281  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  60.77 
 
 		 218 aa  279  3e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  62.04 
 
 		 237 aa  275  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  58.29 
 
 		 220 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  61.57 
 
 		 237 aa  273  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  61.97 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0428  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  58.37 
 
 		 224 aa  268  5e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00313991  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0768  response regulatory protein  57.89 
 
 		 229 aa  263  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  59.17 
 
 		 408 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.67 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0445  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  54.03 
 
 		 228 aa  255  4e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.878124  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0165  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1250  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  52.36 
 
 		 265 aa  235  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  50.23 
 
 		 655 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  51.6 
 
 		 221 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 226 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  49.55 
 
 		 226 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  47.14 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  48.61 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  53.77 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  50.89 
 
 		 254 aa  207  9e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  48.37 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  49.31 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  47.95 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  51.6 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  48.39 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  49.55 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  50.74 
 
 		 225 aa  205  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  52.26 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.98 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  47.73 
 
 		 248 aa  204  9e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  50.25 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  48.18 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  49.07 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.95 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  51.72 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  45.22 
 
 		 254 aa  203  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  49.11 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  44.81 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.77 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  45.3 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  45.3 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  52.48 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  48.15 
 
 		 222 aa  201  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  49.09 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.27 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.77 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  52.22 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3548  ABC transporter related  49.54 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  50.22 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  48.4 
 
 		 221 aa  198  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 		 224 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  49.75 
 
 		 656 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  49.5 
 
 		 226 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  48.18 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  47.69 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  49.5 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  50.49 
 
 		 657 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  46.54 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.4 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.84 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.66 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  46.12 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4327  ABC transporter related protein  49.08 
 
 		 224 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0342425  normal  0.393244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  47.95 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  47.35 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  49.75 
 
 		 657 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.06 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  48.87 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.91 
 
 		 226 aa  195  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>