More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0669 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  42.57 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 		 251 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  41.87 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  43.07 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  42.93 
 
 		 249 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  42.36 
 
 		 191 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0187  Phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460351  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  40.49 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  43.65 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  33.5 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.53 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 412 aa  72  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.81 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  35.66 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  37.67 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  31.52 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  34.06 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  35.03 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 		 370 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.16 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.62 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.03 
 
 		 365 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.03 
 
 		 365 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.03 
 
 		 365 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.94 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.98 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.29 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.66 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.66 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  31.11 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  33.79 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  32.52 
 
 		 452 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  32.39 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  32.09 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  24.59 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.56 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  26.42 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  29.07 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  32.54 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.88 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.37 
 
 		 369 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  25.87 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>