289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3819 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3819  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 318 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5369  hypothetical protein  34.81 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7680  hypothetical protein  30.27 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  34.52 
 
 		 1027 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0559  HWE histidine kinase  29.97 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.690554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 588 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 677 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  31.53 
 
 		 460 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 632 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 577 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4311  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.801495  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  34.22 
 
 		 1165 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 840 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.06 
 
 		 849 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 631 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  34.22 
 
 		 1170 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 583 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  36.32 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  31.25 
 
 		 583 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 583 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  33.69 
 
 		 1170 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1232  signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0779758  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 		 733 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 850 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 465 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 571 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 713 aa  99  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 372 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 488 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 503 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 867 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 553 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 929 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  37.8 
 
 		 1160 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  30.45 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  36.02 
 
 		 844 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 499 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 512 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 347 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2176  putative signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 411 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 571 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 275 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 512 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 341 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 488 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  34.52 
 
 		 332 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 498 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 258 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 491 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  33.68 
 
 		 728 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 728 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4536  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 430 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 559 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 489 aa  92.8  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  27.09 
 
 		 463 aa  92.8  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 482 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 455 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  27.09 
 
 		 463 aa  92.8  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  34.36 
 
 		 483 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 829 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 586 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  36.14 
 
 		 364 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 380 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 713 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  33.84 
 
 		 478 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 662 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  32.38 
 
 		 717 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 934 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 930 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 500 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  33.85 
 
 		 360 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 550 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 635 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 1167 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 572 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  32.65 
 
 		 334 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1483  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 391 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 263 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 488 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 454 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  32.34 
 
 		 488 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  29.9 
 
 		 856 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 550 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.49 
 
 		 846 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  32.94 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 901 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  30.58 
 
 		 930 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0982  hypothetical protein  37.1 
 
 		 143 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.95 
 
 		 1190 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 601 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5742  signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 409 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>