103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4282 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 
375 aa  759    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  84.72 
 
 
384 aa  646    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  58.45 
 
 
455 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  64.08 
 
 
243 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  55.88 
 
 
248 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  61.11 
 
 
244 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  53.8 
 
 
801 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  42.58 
 
 
492 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  52.72 
 
 
803 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  57.24 
 
 
238 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  47.91 
 
 
457 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.3 
 
 
688 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.06 
 
 
689 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  51.34 
 
 
340 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.34 
 
 
597 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  43.64 
 
 
347 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  40.37 
 
 
653 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  47.67 
 
 
654 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  35.86 
 
 
354 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.92 
 
 
638 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  44.27 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  42.13 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  43.75 
 
 
451 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  43.26 
 
 
374 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  39.66 
 
 
415 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  43.96 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  38.34 
 
 
642 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  45.5 
 
 
374 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  39.72 
 
 
235 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  42.71 
 
 
334 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  34.83 
 
 
350 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.16 
 
 
722 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  40.57 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  35.2 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  38.99 
 
 
635 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  41 
 
 
421 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  37.39 
 
 
400 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  39.51 
 
 
662 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  39 
 
 
586 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3503  hypothetical protein  58.33 
 
 
131 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  39.55 
 
 
665 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  31.92 
 
 
459 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  38.89 
 
 
656 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  37.04 
 
 
480 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  38.66 
 
 
596 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  37.11 
 
 
601 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  37.63 
 
 
597 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  34.76 
 
 
600 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  37.57 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.79 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  36.79 
 
 
601 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.21 
 
 
413 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  37.17 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  44.07 
 
 
281 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.63 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.46 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  34.13 
 
 
226 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.82 
 
 
862 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.81 
 
 
398 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.14 
 
 
453 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.25 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  34.82 
 
 
225 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  32.56 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  31.16 
 
 
235 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  34.33 
 
 
188 aa  56.2  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.98 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  30.82 
 
 
298 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  30.6 
 
 
308 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  32.82 
 
 
267 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  35.94 
 
 
347 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  30.07 
 
 
222 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.12 
 
 
500 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  32.59 
 
 
214 aa  52.8  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  31.94 
 
 
251 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  36.45 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  29.52 
 
 
302 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  30 
 
 
223 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  31.91 
 
 
302 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  32.82 
 
 
210 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  35.71 
 
 
192 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  33.08 
 
 
298 aa  49.7  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  30.97 
 
 
804 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  33.59 
 
 
203 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  31.01 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  36.36 
 
 
194 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  31.61 
 
 
220 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  34.25 
 
 
216 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  35.54 
 
 
218 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  34.02 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  31.5 
 
 
167 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  32.32 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  35.64 
 
 
208 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  39.47 
 
 
192 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  32.99 
 
 
218 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 
214 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  35.37 
 
 
234 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  31.82 
 
 
144 aa  43.9  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  34.78 
 
 
279 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  31.43 
 
 
187 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  29.67 
 
 
220 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>