More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2108 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  100 
 
 		 325 aa  663    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  84.35 
 
 		 322 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  55.16 
 
 		 314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  52.6 
 
 		 319 aa  332  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  52.44 
 
 		 324 aa  325  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  56.86 
 
 		 314 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  53.72 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  57.24 
 
 		 322 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  57.24 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  51.49 
 
 		 320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 350 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  56.9 
 
 		 322 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  51.52 
 
 		 319 aa  309  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 319 aa  308  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  53.38 
 
 		 312 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  49.51 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  50.17 
 
 		 307 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  53.04 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  51.53 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  49.35 
 
 		 315 aa  279  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  56.9 
 
 		 510 aa  278  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  46.25 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  46.51 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  46.89 
 
 		 307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  46.36 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  58.7 
 
 		 257 aa  272  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  57.73 
 
 		 512 aa  272  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 307 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.87 
 
 		 311 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  51.34 
 
 		 248 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  54.94 
 
 		 594 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  54.34 
 
 		 270 aa  265  8e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  47.25 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  45.61 
 
 		 312 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  42.99 
 
 		 667 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  47.78 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  45.3 
 
 		 323 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  44.16 
 
 		 651 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  46.33 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  52.91 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  46.93 
 
 		 313 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  42.76 
 
 		 308 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  46.45 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  42.33 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.93 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  47.32 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  46.5 
 
 		 323 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  46.91 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  43 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  47.56 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  45.54 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  43.79 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  41.16 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  45.3 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  41.85 
 
 		 340 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  45.03 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  45.3 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  54.39 
 
 		 582 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  44.3 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  43.93 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  44.84 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  54.46 
 
 		 590 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  44.23 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  48.18 
 
 		 317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  46.13 
 
 		 323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  43.77 
 
 		 318 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  46.6 
 
 		 316 aa  252  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  53.25 
 
 		 590 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.71 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  44.19 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  43.77 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  43.79 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  43.79 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  51.09 
 
 		 578 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  51.09 
 
 		 578 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  51.09 
 
 		 578 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 		 578 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 		 578 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  54.42 
 
 		 581 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 		 578 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  51.09 
 
 		 578 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 		 578 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 		 578 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  55.4 
 
 		 585 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  49.51 
 
 		 302 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 315 aa  248  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  49.35 
 
 		 580 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  53.39 
 
 		 579 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  52.94 
 
 		 255 aa  248  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  53.92 
 
 		 575 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  43.42 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  43.87 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  46.44 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  54.05 
 
 		 576 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  52.8 
 
 		 580 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>