More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0229 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  100 
 
 		 354 aa  694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  83.73 
 
 		 353 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  37.13 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  35.92 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1551  beta-lactamase  30.52 
 
 		 375 aa  96.3  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0670758  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0661  beta-lactamase  32.86 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.0854039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.95 
 
 		 453 aa  89.4  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1189  beta-lactamase  30.56 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14808  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0154  beta-lactamase  31.46 
 
 		 271 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  36.96 
 
 		 370 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  31.55 
 
 		 513 aa  86.3  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  38.82 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  35.45 
 
 		 5698 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  28.9 
 
 		 507 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  30.58 
 
 		 513 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21250  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.89 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.73 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  30.57 
 
 		 514 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  29.89 
 
 		 498 aa  82.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  35.79 
 
 		 528 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  35.79 
 
 		 528 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  29.89 
 
 		 498 aa  82.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  28.27 
 
 		 1055 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  31.07 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  27.95 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  33.15 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3047  beta-lactamase  35.76 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3764  beta-lactamase  29.54 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  36.02 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2769  beta-lactamase  30.39 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609547  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30360  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  37.66 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0095  beta-lactamase  30.69 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  33.33 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  29.17 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  36.42 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.64 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  37.93 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12285  hypothetical protein  30.36 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  31.55 
 
 		 513 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.47 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.03 
 
 		 582 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.55 
 
 		 508 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  35.42 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  35.54 
 
 		 450 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  36.42 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3377  beta-lactamase  29.28 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.324805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3439  beta-lactamase  29.28 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00292415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3388  beta-lactamase  29.28 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  30.61 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.61 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  30.53 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  28.65 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  33.14 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.62 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15330  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.64 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.499856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  27.73 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  26.14 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  33.66 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  35.12 
 
 		 507 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  32.37 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  32.95 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  34.27 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26910  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.18 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.125472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.33 
 
 		 1032 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  33.56 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  37.5 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  29.83 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29.89 
 
 		 966 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  25.57 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  32.84 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.57 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  35.09 
 
 		 635 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3127  beta-lactamase  29.31 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  29.59 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  25.46 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6294  beta-lactamase  29.95 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  26.4 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  33.91 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  30 
 
 		 670 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  33.33 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  37.5 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  33.17 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  30.41 
 
 		 694 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  29.59 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  26.04 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  26.25 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.53 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  34.83 
 
 		 530 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0329  beta-lactamase  31.13 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.021088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  29.45 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  31.05 
 
 		 713 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  30.32 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  25.69 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  33.08 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1775  putative esterase  31.13 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0970  putative esterase  31.13 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.216646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2028  beta-lactamase  29.68 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0408  putative esterase  31.13 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0233  putative esterase  31.13 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  31.13 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>