More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4695 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  71.36 
 
 		 207 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  49.1 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  41.03 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  43.05 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  36.1 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  33.51 
 
 		 216 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 425 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  33.73 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  34.32 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  32.58 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  37.65 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  43.3 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  43.3 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  43.3 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 363 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  34.87 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  32.09 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  31.08 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  39.36 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  38.98 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  34.59 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  38.53 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  32.99 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  31.58 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  28.24 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  30.17 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  28.06 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  35.78 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  44.71 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  35.29 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  41.46 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  35.92 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  28.7 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  37.11 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  31.51 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  39.81 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  32.76 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  38.14 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  27.34 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  32.76 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  30.83 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  38.46 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  38.46 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  38.46 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  27.39 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  30.83 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  27.39 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  30.54 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  30.08 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  32.28 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  29.05 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  38.46 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  27.69 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  38.38 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  28.68 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  30.46 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  32.09 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  29.77 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  31.5 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  29.14 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  33.64 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  35.05 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  30.95 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  31.75 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  36.08 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  27.41 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  35.85 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  39.51 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  39.51 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  39.51 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  37.23 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  32.23 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4325  hypothetical protein  30.97 
 
 		 182 aa  62  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.829892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  39.51 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  29.14 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  26.88 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  29.01 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  30.52 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>