109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0630 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  92.52 
 
 		 435 aa  811    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  100 
 
 		 432 aa  887    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  63.3 
 
 		 436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  63.35 
 
 		 412 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  66.27 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  46.37 
 
 		 318 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  43.53 
 
 		 343 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.55 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  31.27 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  30.46 
 
 		 465 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  31.13 
 
 		 546 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  29.89 
 
 		 548 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32 
 
 		 439 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  31.07 
 
 		 512 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  30.94 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  30.94 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  30.38 
 
 		 372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  32.42 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.19 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  30.73 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  30.71 
 
 		 289 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  29.88 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  32.18 
 
 		 512 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  29.02 
 
 		 293 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.81 
 
 		 831 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  29.47 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.82 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 1032 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.14 
 
 		 2413 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.33 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.65 
 
 		 685 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.22 
 
 		 684 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1493 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1402 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3443  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.93 
 
 		 248 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.93 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  28.25 
 
 		 557 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  28.21 
 
 		 961 aa  53.9  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.99 
 
 		 373 aa  53.5  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3379  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.93 
 
 		 248 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.287446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  32.43 
 
 		 228 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00770  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 		 763 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104071  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  26.43 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  28.26 
 
 		 373 aa  50.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.31 
 
 		 528 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  37.04 
 
 		 357 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_003296  RS00395  hypothetical protein  32.77 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0399379  normal  0.95262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  24.62 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  36.08 
 
 		 789 aa  49.3  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.17 
 
 		 565 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.78 
 
 		 321 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05223  hypothetical protein  37.8 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  25.98 
 
 		 490 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.05 
 
 		 232 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  28.99 
 
 		 255 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  30.48 
 
 		 358 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1153  Sel1 domain-containing protein  27.23 
 
 		 267 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  30.63 
 
 		 276 aa  47  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  25.49 
 
 		 490 aa  47  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  30.37 
 
 		 359 aa  47  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  28.16 
 
 		 552 aa  47  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3301  Sel1  31.15 
 
 		 261 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  30.61 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  26.47 
 
 		 254 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  33.63 
 
 		 1081 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  24.06 
 
 		 940 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  28.04 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  27.59 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  28.26 
 
 		 839 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 		 705 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 		 798 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  23.53 
 
 		 850 aa  45.8  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.35 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  26.92 
 
 		 241 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  30.07 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  26.06 
 
 		 693 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  33.96 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0605  sporulation domain-containing protein  33.75 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690459  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  36.71 
 
 		 175 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3190  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.85 
 
 		 184 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  38.04 
 
 		 722 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0479  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.7 
 
 		 190 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237479  hitchhiker  0.0000406218 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0303  hypothetical protein  28.7 
 
 		 190 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.921307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  29.1 
 
 		 247 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  27.18 
 
 		 817 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  32.98 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  38.04 
 
 		 722 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  38.04 
 
 		 722 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0097  Sel1  27.27 
 
 		 254 aa  43.9  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  29.75 
 
 		 331 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.78 
 
 		 163 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.84 
 
 		 890 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  29.75 
 
 		 331 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  29.75 
 
 		 331 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  40.82 
 
 		 211 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0976  Sel1 domain-containing protein  33.96 
 
 		 269 aa  43.5  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.135872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  30 
 
 		 1281 aa  43.1  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>