More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1911 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  100 
 
 		 460 aa  882    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  33.89 
 
 		 461 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  33.55 
 
 		 479 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  33.49 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  33.33 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  33.19 
 
 		 471 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  31.99 
 
 		 492 aa  203  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  32.24 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  34.04 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  30.18 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  33.73 
 
 		 478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  33.89 
 
 		 478 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  32 
 
 		 482 aa  190  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  32.9 
 
 		 486 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  30.57 
 
 		 483 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  30.57 
 
 		 482 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  31.75 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  28.4 
 
 		 495 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  30.79 
 
 		 475 aa  151  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.93 
 
 		 472 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.25 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  26.51 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.37 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  29.53 
 
 		 507 aa  106  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  26.46 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.82 
 
 		 484 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.73 
 
 		 533 aa  98.2  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  28.1 
 
 		 496 aa  96.7  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  27.9 
 
 		 509 aa  96.7  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 462 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.63 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.58 
 
 		 488 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  27.37 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  24.79 
 
 		 510 aa  94.4  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.6 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.86 
 
 		 493 aa  94  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  24.44 
 
 		 524 aa  93.6  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  23.19 
 
 		 487 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  26.87 
 
 		 592 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  27.03 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  24.4 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  24.4 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  24.84 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  23.8 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.89 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  25.9 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  27.05 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  24 
 
 		 571 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  27.84 
 
 		 506 aa  90.5  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  23.73 
 
 		 571 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 486 aa  90.1  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  23.52 
 
 		 571 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  23.52 
 
 		 571 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  23.52 
 
 		 571 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  23.52 
 
 		 571 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  25.35 
 
 		 482 aa  89.7  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.17 
 
 		 459 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.06 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  27.17 
 
 		 493 aa  88.2  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  23.6 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  25.23 
 
 		 492 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  24.61 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1038  hypothetical protein  25.27 
 
 		 487 aa  87.4  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.52 
 
 		 522 aa  87  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.04 
 
 		 483 aa  86.7  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  24.88 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.73 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.22 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.29 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  25.32 
 
 		 475 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.5 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.73 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.5 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  24.88 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.5 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.5 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.5 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  24.88 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  28.53 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  25.29 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  23.38 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.5 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  23.99 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  24.88 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  24.88 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  25.29 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  24.88 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  23.4 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  25.47 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  28.7 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  23.73 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  28.37 
 
 		 587 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  28.24 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  28.24 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  25.06 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.88 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.88 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.88 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  25.85 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0939  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1157 aa  84  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.186942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>