228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0583 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  47.74 
 
 		 313 aa  281  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  33.08 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  34.33 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  33.96 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  33.05 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  28.62 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  32.34 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  28.41 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  26.79 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  26.87 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  29.62 
 
 		 315 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  26.54 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.77 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  25.18 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  27.2 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  22.26 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.3 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  27.06 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  26.29 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  23.87 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  21.79 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  29.34 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  22.34 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  27.09 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  21.92 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  24.52 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  26.64 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.09 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  25.43 
 
 		 349 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  25.2 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  25.2 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.33 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  23.83 
 
 		 438 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  27.05 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1853  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  26.05 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  24.56 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  22.1 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  23.42 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  24.92 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  28.08 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  24.06 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  26.1 
 
 		 364 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  23.34 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  23.76 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.84 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  24 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  23 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 342 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  32.45 
 
 		 227 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  24.75 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  26.85 
 
 		 637 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  24.64 
 
 		 310 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>