More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5340 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  100 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  93.36 
 
 		 241 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  46.64 
 
 		 249 aa  191  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4324  GntR domain-containing protein  45.09 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  40.71 
 
 		 379 aa  168  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.04 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.57 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  31.34 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  31.51 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  28.9 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  32.27 
 
 		 271 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  27.1 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  28.57 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 236 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  27.6 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  27.98 
 
 		 234 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  30.94 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  27.98 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.57 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.57 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  31.78 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  31.76 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  30.04 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  26.98 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  29.02 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  31.75 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  28.37 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  32.41 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  27.44 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.34 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  28.63 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  27.11 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  29.03 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  30.57 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6475  GntR-like  28.57 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6316  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855899  normal  0.236582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  32.46 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6710  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  30.97 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  30.14 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  27.49 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  30.29 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  29.49 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  30.66 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  26.99 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  26.99 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 337 aa  75.5  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  26.99 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  26.99 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  26.99 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  26.99 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  26.99 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  26.99 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  26.99 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  29.95 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  28.64 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  28.38 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  26.96 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.32 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  29.95 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  29.49 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  26.96 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  27.56 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  26.96 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  26.96 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  26.96 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  26.43 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  27.67 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>