More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0346 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  97.54 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  67.21 
 
 		 244 aa  346  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  63.93 
 
 		 241 aa  324  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  49.38 
 
 		 239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  46.89 
 
 		 243 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  44.03 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  45.27 
 
 		 241 aa  211  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  44.73 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  44.3 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  44.3 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  44.03 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  43.39 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  42.56 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  42.56 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  44.26 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  40.32 
 
 		 246 aa  177  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  35.68 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  34.27 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  36.09 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  33.07 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  33.84 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  34.01 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  34.3 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  34.65 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.55 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  32.26 
 
 		 256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  33.2 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  34.82 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  34.47 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  34.02 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  34.02 
 
 		 239 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  33.2 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  32.77 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  32.3 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  35.06 
 
 		 248 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  34 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  35.2 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  33.98 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  30.04 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.3 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  33.6 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  31.8 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  33.47 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  32 
 
 		 246 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  29.57 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  32.24 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  29.86 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  32.24 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  32.06 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  30.74 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.04 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  30.56 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  30.95 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.06 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  31 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  31.62 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  32.51 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.35 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  30.56 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.89 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  31.6 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  29.96 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.49 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  30.12 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  29.64 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.04 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  28.79 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2263  hypothetical protein  28.35 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  31.8 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  34.38 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  28.63 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.71 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  29.15 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  29.15 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  30.98 
 
 		 246 aa  88.6  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.15 
 
 		 261 aa  88.6  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  29.3 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  30.54 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0026  fagellar hook-basal body protein  25.48 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.64 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  28.95 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  32.79 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2505  flagellar basal body rod protein  32.88 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0291035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  28.19 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  32.79 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1352  flagellar basal body rod protein  32.88 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020401  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  32.79 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.34 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  32.78 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1228  flagellar basal body rod protein FlgF  29.25 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  29.8 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  31.23 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.34 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.34 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.96 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.57 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>