More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2562 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  100 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  47.16 
 
 		 245 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  46.09 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  43.32 
 
 		 246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  43.32 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  44.03 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  42.91 
 
 		 246 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  43.15 
 
 		 246 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  42.63 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  42.17 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  40.4 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  43.37 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  40.64 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  41.32 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  42.4 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  42 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  39.58 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  40.89 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  39.3 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  37.66 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  36.67 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  39.29 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  38.86 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  36.25 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  36.67 
 
 		 239 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  37.6 
 
 		 248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  39.13 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  34.84 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  36.21 
 
 		 247 aa  141  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  32.93 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  37.87 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.27 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  36.6 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  33.75 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  34.16 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  32.38 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  31.84 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  35.43 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  38.26 
 
 		 242 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  30.89 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  31.97 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  31.97 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.15 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  32.79 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  31.15 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  36.14 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  32.26 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  34.12 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.42 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  31.37 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  34.4 
 
 		 269 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  35.09 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  35.09 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  33.83 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  33.83 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  30.58 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.11 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.84 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.79 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  30.17 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  34.15 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.27 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.46 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  30.17 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  33.77 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  32.77 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3366  flagellar basal body rod protein FlgG  32.96 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  30.89 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0268  flagellar basal body rod protein FlgG  32.96 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0921  hypothetical protein  30.83 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.95 
 
 		 266 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.95 
 
 		 266 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.92 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  31.25 
 
 		 282 aa  117  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  35.54 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  31.05 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.59 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2747  fagellar hook-basal body protein  34 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000847509  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  32.11 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  33.71 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  31.93 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  34.24 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.7 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  33.98 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  33.71 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  33.59 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.46 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  34.09 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1249  hypothetical protein  30.61 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0478711  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  33.98 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.84 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.84 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.06 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>