More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3251 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 238 aa  482  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  55.04 
 
 		 240 aa  269  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  55.93 
 
 		 238 aa  254  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  54.43 
 
 		 239 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  54.43 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  55.27 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  49.16 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  39.48 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  39.58 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  37.96 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  36.59 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  35.68 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  36.14 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  36.1 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  33.75 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  35.68 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.88 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  36.4 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  37.25 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  35.2 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  32.78 
 
 		 242 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  36.63 
 
 		 248 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  34.43 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  34.4 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  36.63 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  32.37 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  32.37 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  32.81 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  34.73 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  32.92 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  30.42 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  33.05 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  31.42 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  35.63 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  33.83 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  33.83 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  33.83 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  33.83 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  33.83 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  33.83 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  33.83 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  33.05 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  32.63 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  29.69 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  34.43 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  31.62 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  34.43 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  31.62 
 
 		 269 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  33.58 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  33.83 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  33.96 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  33.96 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.3 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  33.96 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  33.96 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  33.91 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  37.2 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  33.83 
 
 		 262 aa  118  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.15 
 
 		 259 aa  118  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  33.61 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  30.61 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  33.96 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  32.39 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  32.97 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  30.95 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  33.08 
 
 		 260 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.46 
 
 		 263 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  30.58 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  32.68 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  30.58 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  32.75 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  31.17 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.6 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.8 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  33.87 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  33.6 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  32.95 
 
 		 260 aa  111  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.33 
 
 		 262 aa  111  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  36.84 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  30.31 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  32.13 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.46 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.46 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  34.71 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  31.76 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  33.06 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  29.79 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2702  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.67 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  30 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  33.72 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  33.72 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  32.21 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  32.14 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  32.96 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>