More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2604 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 239 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  84.52 
 
 		 239 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  83.26 
 
 		 239 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  56.12 
 
 		 240 aa  268  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  56.54 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  55.17 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  55.27 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  40.08 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  34.82 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  36.67 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  36.4 
 
 		 239 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  37.14 
 
 		 248 aa  141  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  38.67 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  33.61 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  36.6 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  33.05 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  34.84 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  34.84 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  35.48 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  35.1 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  35.51 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  34.02 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  34.29 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  30.49 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.48 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  32.48 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.11 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  35.65 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  31.62 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  31.62 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  31.75 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  30.83 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  35.19 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  33.05 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  33.48 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  30.42 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  32.26 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  32.1 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  32.24 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  29.58 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  34.85 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.5 
 
 		 259 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  29.79 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  33.61 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  32.14 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  32.66 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  32.66 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  32.26 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  31.25 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  28.46 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  31.71 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  33.06 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0258  flagellar basal body rod protein FlgG  31.85 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  33.6 
 
 		 249 aa  105  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3787  flagellar basal body rod protein FlgG  32.17 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0961005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  30.61 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.79 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  34.26 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  34.27 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  33.47 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  33.92 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4423  flagellar basal body rod protein FlgG  31.4 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  32.53 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  30.97 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4675  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.67 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039193 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  33.2 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  29.66 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.68 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1383  flagellar basal body rod protein FlgG  30.68 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1506  flagellar basal body rod protein FlgG  30.83 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  31.27 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.82 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  31.92 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.82 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  31.62 
 
 		 251 aa  99.8  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.45 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.43 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  30.08 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  30 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1121  flagellar basal body rod protein FlgG  29.63 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.88 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0027  flagellar basal body rod protein FlgG  33.92 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2023  fagellar hook-basal body protein  30.04 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  31.85 
 
 		 262 aa  98.6  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.53 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  29.13 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  32.94 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  34.43 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  36.36 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  32.43 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  32.35 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  28.11 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  33.47 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3245  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.27 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1714  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.43 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.82 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0823  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.27 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214606  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.56 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>