More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0391 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 265 aa  541  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  55.51 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  55.85 
 
 		 260 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  51.53 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.3 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  37.31 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  39.61 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  38.55 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  36.86 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.55 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.55 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  36.4 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.66 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.46 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.46 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  32.97 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.12 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  36.14 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  36.59 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.96 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  33.58 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.7 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.68 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  35.58 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2185  flagellar basal-body rod protein  35.38 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00385896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  37.8 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1020  flagellar distal rod protein FlgG  33.09 
 
 		 269 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  34.83 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.09 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.21 
 
 		 261 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  33.6 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  34.09 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  32.73 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  32.09 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  34.17 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.63 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.83 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  32.96 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1309  flagellar basal-body rod protein  33.33 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000564283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  36.9 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  34.93 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  32.71 
 
 		 243 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  34.41 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  34.41 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  31.42 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.54 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  36.16 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.41 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  33.73 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.86 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.42 
 
 		 267 aa  123  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.23 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  32.94 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.41 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  38.96 
 
 		 264 aa  123  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  33.84 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.46 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  32.45 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004168  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.45 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  35.97 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  35.97 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.59 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  34.32 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.61 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.61 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  35.19 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.87 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  32.73 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.69 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 260 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1421  flagellar basal body rod protein FlgG  35.6 
 
 		 262 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2942  flagellar basal body rod protein FlgG  35.6 
 
 		 262 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  32.73 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0522  flagellar basal-body rod protein  35.47 
 
 		 270 aa  121  9e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.133039  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.69 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  32.95 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  34.96 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2957  flagellar basal body rod protein FlgG  35.2 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.711703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2592  flagellar basal body rod protein FlgG  35.95 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3244  flagellar basal body rod protein FlgG  35.51 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  33.58 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2333  flagellar basal body rod protein FlgG  36.89 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  36.36 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.898516  normal  0.0829972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.73 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  31.3 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0720  flagellar basal-body rod protein  32.62 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000227906  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  33.62 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2264  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.73 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  35.56 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01292  flagellar basal body rod protein FlgG  37.04 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1334  flagellar basal body rod protein FlgG  36.36 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1787  flagellar basal body rod protein FlgG  37.04 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1350  flagellar basal body rod protein FlgG  35.92 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1264  flagellar basal body rod protein FlgG  36.36 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.82 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  35.11 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  35.2 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.15 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  33.46 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  34.85 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>