More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3448 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  100 
 
 
245 aa  497  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  57.89 
 
 
242 aa  291  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  56.91 
 
 
244 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  54.44 
 
 
258 aa  279  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  57.09 
 
 
242 aa  278  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  53.06 
 
 
238 aa  231  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  52.65 
 
 
237 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  39.2 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  39.76 
 
 
251 aa  168  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  37.35 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.93 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.21 
 
 
270 aa  145  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  32.39 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  35.29 
 
 
269 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  32.8 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  34.6 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1157  flagellar basal body rod protein  35.86 
 
 
245 aa  134  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  36.92 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.09 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.69 
 
 
263 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  35.43 
 
 
256 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  34.01 
 
 
244 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  30.04 
 
 
233 aa  131  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  36.47 
 
 
261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  34.01 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  32.8 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  34.51 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  33.96 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2834  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.37 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  30.5 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  34.5 
 
 
259 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  30.56 
 
 
253 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.85 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  32.8 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.09 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  34.09 
 
 
266 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  34.6 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.36 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.36 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  34.6 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.3 
 
 
267 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2912  flagellar basal body rod protein FlgG  34.75 
 
 
261 aa  125  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.157817  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  33.76 
 
 
242 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.22 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  31.08 
 
 
246 aa  124  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  33.98 
 
 
262 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.32 
 
 
270 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  35.27 
 
 
253 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  31.47 
 
 
255 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  33.6 
 
 
241 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  34.34 
 
 
260 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.98 
 
 
261 aa  123  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  31.02 
 
 
246 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.39 
 
 
262 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.73 
 
 
266 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  32.54 
 
 
253 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.73 
 
 
266 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  33.46 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  32.7 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.56 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  31.87 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  35.58 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  35.66 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1714  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.58 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  35.02 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  34.94 
 
 
262 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  31.27 
 
 
257 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  30.62 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  34.38 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2263  hypothetical protein  31.97 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  34.72 
 
 
262 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  33.2 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.38 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  32 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  31.78 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.21 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  32.13 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  31.38 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.31 
 
 
260 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  31.5 
 
 
270 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  32.39 
 
 
238 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.82 
 
 
261 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.35 
 
 
260 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.06 
 
 
263 aa  116  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.35 
 
 
260 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.43 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004168  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.57 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  35.91 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  34.05 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1309  flagellar basal-body rod protein  30.8 
 
 
270 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000564283  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  35.54 
 
 
248 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01292  flagellar basal body rod protein FlgG  32.58 
 
 
262 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1657  flagellar basal body rod protein  33.88 
 
 
236 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.21 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0334  flagellar basal body rod protein  34.85 
 
 
240 aa  115  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  31.64 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.05 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  31.6 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>