More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2264 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2264  flagellar basal-body rod protein FlgG  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  45.8 
 
 		 262 aa  242  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.51 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  43.89 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  43.82 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  43.89 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.83 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.91 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1156  flagellar basal body rod protein FlgG  43.68 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  42.91 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  42.42 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.07 
 
 		 266 aa  223  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  44.66 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  41.22 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  43.89 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.96 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.02 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  43.97 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  42.64 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.41 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  43.13 
 
 		 266 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.94 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3476  flagellar basal body rod protein FlgG  40.46 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109253  normal  0.202824 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.13 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.22 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.86 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.35 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.35 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.13 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.51 
 
 		 264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.8 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  42.59 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  40.93 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  42.59 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.06 
 
 		 263 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  41.44 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  41 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  42.41 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  42.41 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  40.15 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  40.55 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1007  flagellar basal body rod protein FlgG  43.02 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1689  flagellar basal body rod protein FlgG  44.06 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2313  flagellar basal body rod protein FlgG  42.11 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  40 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  40 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  40.91 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000584839  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  39.39 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  41.83 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.63 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1264  flagellar basal body rod protein FlgG  41.35 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1166  flagellar basal body rod protein FlgG  40.93 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  41.92 
 
 		 262 aa  205  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3244  flagellar basal body rod protein FlgG  40 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.11 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1350  flagellar basal body rod protein FlgG  41.35 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2592  flagellar basal body rod protein FlgG  40.6 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1482  flagellar basal body rod protein FlgG  43.18 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.655215  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.63 
 
 		 260 aa  205  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0797  flagellar basal body rod protein FlgG  40.91 
 
 		 263 aa  204  8e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0866947  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0721  flagellar basal body rod protein FlgG  40.91 
 
 		 263 aa  204  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000178578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  40.98 
 
 		 262 aa  204  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.898516  normal  0.0829972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  41.13 
 
 		 262 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1602  flagellar basal body rod protein FlgG  40.6 
 
 		 262 aa  204  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2942  flagellar basal body rod protein FlgG  40.15 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.11 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2957  flagellar basal body rod protein FlgG  39.77 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.711703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1421  flagellar basal body rod protein FlgG  40.15 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1334  flagellar basal body rod protein FlgG  40.98 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.61 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  42.86 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  40 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  40 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  40 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  40 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  40 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  39.31 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3082  flagellar basal body rod protein FlgG  40.23 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  40 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  40.6 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1506  flagellar basal body rod protein FlgG  42.46 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  39.62 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  39.62 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.3 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  38.85 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  39.62 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  39.62 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  41.79 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  39.62 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  39.62 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.94 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0242  flagellar basal body rod protein FlgG  42.08 
 
 		 262 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.35 
 
 		 261 aa  202  7e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  40.93 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0189  flagellar basal body rod protein FlgG  42.08 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  41.34 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  39.53 
 
 		 261 aa  201  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  39.53 
 
 		 261 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  41.34 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>