More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1122 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 255 aa  519  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  88.24 
 
 		 255 aa  467  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  72.94 
 
 		 254 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  63.53 
 
 		 253 aa  341  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  61.18 
 
 		 253 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  59.22 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  62.75 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  47.83 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  48.22 
 
 		 248 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  47.43 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  48.62 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  46.25 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  46.25 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  41.27 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  40.64 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  41.83 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  40.55 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  38.59 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  38.17 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  35.83 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  42.01 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  36.4 
 
 		 243 aa  138  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  35.04 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  41.82 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  35.29 
 
 		 247 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.05 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  35.04 
 
 		 238 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  32.8 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  34.51 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  36.89 
 
 		 262 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  37.14 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  33.47 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  37.14 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  37.14 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  37.14 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  37.14 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  37.14 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  34.51 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  34.51 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  33.47 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  37.14 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  36.73 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  36.73 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  36.73 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  36.73 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  36.33 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  36.73 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.8 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.74 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.07 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  37.14 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.1 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  35.51 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  35.51 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  36.33 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  34.39 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  37.14 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  35.96 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  33.85 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  31.62 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  35.25 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  36.12 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.77 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  32.41 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  34.47 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  33.08 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  33.72 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  33.73 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.72 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.46 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  34.87 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  34.87 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  31.87 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  33.74 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.68 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.68 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.96 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.96 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.02 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.89 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  34.87 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  35.92 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  34.45 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  34.45 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  34.45 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  31.89 
 
 		 243 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  34.45 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  34.45 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  33.46 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  32.93 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  32.93 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  32.93 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  36.96 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  34.06 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  31.92 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  32.92 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  37.55 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  32.68 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>