More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3763 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  94.12 
 
 		 237 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  66.12 
 
 		 244 aa  322  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  59.26 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  57.14 
 
 		 242 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  53.06 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  52.33 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  39.52 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.52 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  37.04 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  38.49 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  39.29 
 
 		 253 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  38.67 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  39.06 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  39.13 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.78 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  38.74 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.92 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.09 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  37.15 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  36.8 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  34.69 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  36.8 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  36.86 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  36 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  35.04 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  35.97 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  33.07 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  34.16 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  32.37 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  35.57 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.3 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  35.98 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.11 
 
 		 262 aa  128  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  37.92 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  35.56 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  36.9 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  36.61 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  35.12 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  31.56 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  36.61 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  36.61 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  36.61 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  31.97 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  36.61 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  36.61 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  36.61 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  34.75 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  33.74 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  33.6 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  35.02 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2023  fagellar hook-basal body protein  35.52 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.19 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.25 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  32.64 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2263  hypothetical protein  34.44 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  36.23 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  32.16 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  32.18 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  35.83 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  31.82 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  35.69 
 
 		 262 aa  121  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  31.67 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.23 
 
 		 263 aa  121  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.41 
 
 		 260 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  35.69 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  35.69 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  35.69 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.7 
 
 		 265 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  32.45 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  33.08 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2834  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.21 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.22 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  33.84 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  35.69 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  35.69 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  35.69 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  35.29 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.48 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.58 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  31.21 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  35.29 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  35.02 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  34.22 
 
 		 266 aa  118  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  29.34 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.2 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  35 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  33.88 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  35 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  34.12 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0921  hypothetical protein  33.07 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  31.94 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.27 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  30.13 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  30.13 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.98 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  33.09 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.98 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>