More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2263 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2263  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  520  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  39.43 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.89 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  35.1 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  32.24 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  34.96 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  32.4 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.8 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  31.97 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  28.14 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  34.98 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  33.6 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  32.52 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  34.44 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  32.7 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  32.05 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  29.86 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  36.12 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.61 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  30.27 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  35.11 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  30.12 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  31.49 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  33.71 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  33.71 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  33.71 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  34.43 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.52 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  29.77 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  31.82 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.08 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  31.82 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.85 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  27.46 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  33.61 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.56 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.42 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  33.61 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  33.61 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  30.61 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.53 
 
 		 270 aa  98.6  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  34.02 
 
 		 247 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2834  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.13 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1290  flagellar basal body rod protein FlgF  31.44 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0203171 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  27.56 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1275  flagellar basal body rod protein FlgF  31.44 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.658738  hitchhiker  0.00859374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1246  flagellar basal body rod protein FlgF  31.44 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326138  normal  0.233716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2194  flagellar basal body rod protein FlgF  31.44 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000311008 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  30 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0258  flagellar basal body rod protein FlgG  33.21 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1206  hypothetical protein  28.68 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0981991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  33.91 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1249  hypothetical protein  28.74 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0478711  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.38 
 
 		 246 aa  96.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1456  flagellar basal body rod protein FlgF  32.58 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.965329  hitchhiker  0.00040155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2010  flagellar basal body rod protein FlgF  31.44 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.59 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01073  flagellar component of cell-proximal portion of basal-body rod  35 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2569  flagellar basal-body rod protein FlgF  35 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.893444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  31.78 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  30.83 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01081  hypothetical protein  35 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.95 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.95 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  29.96 
 
 		 244 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  32.21 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2051  flagellar basal body rod protein FlgF  35.42 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  34.02 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  30.57 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  30.65 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  34.02 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  34.02 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.77 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.77 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.56 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  30.71 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1200  flagellar basal body rod protein FlgF  35 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.95 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2523  flagellar basal body rod protein FlgF  35 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408348  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  34.02 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  32.46 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  32.46 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  31.51 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  31.4 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  30.31 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  30.29 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2702  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.19 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  28.52 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0921  hypothetical protein  24.9 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  33.2 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1200  flagellar basal body rod protein FlgF  34.58 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4676  flagellar basal body rod protein FlgG  32.58 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103998 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  32.81 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  32.68 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  31.06 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  30.94 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  30.94 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3281  flagellar basal body rod protein  28.25 
 
 		 278 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000663346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2248  flagellar basal body rod protein FlgF  32.2 
 
 		 251 aa  92  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>