More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2569 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01073  flagellar component of cell-proximal portion of basal-body rod  100 
 
 		 251 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1456  flagellar basal body rod protein FlgF  99.6 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.965329  hitchhiker  0.00040155 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2569  flagellar basal-body rod protein FlgF  100 
 
 		 251 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.893444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2523  flagellar basal body rod protein FlgF  99.2 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408348  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01081  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2051  flagellar basal body rod protein FlgF  99.6 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216259 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1200  flagellar basal body rod protein FlgF  98.8 
 
 		 251 aa  500  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2248  flagellar basal body rod protein FlgF  99.2 
 
 		 251 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777669  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1200  flagellar basal body rod protein FlgF  98.8 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1591  flagellar basal body rod protein FlgF  86.85 
 
 		 251 aa  444  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2194  flagellar basal body rod protein FlgF  86.85 
 
 		 251 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000311008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1275  flagellar basal body rod protein FlgF  86.85 
 
 		 251 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.658738  hitchhiker  0.00859374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1246  flagellar basal body rod protein FlgF  86.85 
 
 		 251 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326138  normal  0.233716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1290  flagellar basal body rod protein FlgF  86.85 
 
 		 251 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0203171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2010  flagellar basal body rod protein FlgF  86.45 
 
 		 251 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2594  flagellar basal body rod protein FlgF  72.4 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2966  flagellar basal body rod protein FlgF  73.31 
 
 		 251 aa  364  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.754778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1872  flagellar basal body rod protein FlgF  71.2 
 
 		 251 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1557  flagellar basal body rod protein  67.73 
 
 		 251 aa  351  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1529  flagellar basal body rod protein  69.32 
 
 		 251 aa  348  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2320  flagellar basal body rod protein FlgF  66.53 
 
 		 251 aa  338  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2421  flagellar basal body rod protein FlgF  66.53 
 
 		 251 aa  338  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.778215  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  56.8 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24040  flagellar basal-body rod protein  54.8 
 
 		 251 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  56 
 
 		 247 aa  261  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2002  flagellar basal body rod protein FlgF  64.5 
 
 		 209 aa  261  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1974  flagellar basal-body rod FlgF  54.98 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  53.88 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  53.88 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  53.28 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  53.28 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  53.28 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  54.26 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  52.9 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  52.9 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  52.9 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  52.9 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  52.9 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  53.49 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  53.49 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  53.49 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  53.88 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  53.88 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  53.1 
 
 		 252 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  52.99 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  48.02 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1325  flagellar basal body rod protein FlgF  49.22 
 
 		 250 aa  221  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2952  flagellar basal body rod protein FlgF  53.49 
 
 		 252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0753  hypothetical protein  47.22 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  49.79 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  50.59 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.24 
 
 		 241 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  44.36 
 
 		 246 aa  201  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.84 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0346  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.42 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  0.715732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.43 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  43.08 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  43.08 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  43.08 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.06 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  42.69 
 
 		 247 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  42.69 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.84 
 
 		 247 aa  195  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.85 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3831  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.85 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212792  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  42.69 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.86 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  41.9 
 
 		 247 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  41.9 
 
 		 247 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  42.29 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  42.69 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0897  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.65 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  43.98 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  41.11 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  45.45 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2314  flagellar basal body rod protein FlgF  42.46 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.222924 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  40.71 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  41.11 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2846  flagellar basal body rod protein FlgF  41.5 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0922396 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4787  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.65 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3710  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.65 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.414142 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.8 
 
 		 246 aa  181  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1221  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.46 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1902  flagellar basal body rod protein FlgF  42.46 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.2 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2374  hypothetical protein  42.63 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.970288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  40.25 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.08 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2209  flagellar basal body rod protein FlgF  38.34 
 
 		 249 aa  175  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  40.66 
 
 		 246 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1106  flagellar basal body rod protein FlgF  40.16 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  40.83 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  38.82 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  38.1 
 
 		 249 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  36.76 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0629  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.57 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  40.83 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  38.1 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1267  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.49 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>