More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3579 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  100 
 
 
247 aa  504  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  55.33 
 
 
246 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3947  flagellar basal body rod protein FlgF  55.33 
 
 
246 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  54.51 
 
 
246 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3727  flagellar basal body rod protein FlgF  55.74 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1501  flagellar basal body rod protein FlgF  54.92 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2209  flagellar basal body rod protein FlgF  53.44 
 
 
249 aa  269  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  55.33 
 
 
246 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  54.51 
 
 
246 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  54.25 
 
 
249 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  53.85 
 
 
249 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2846  flagellar basal body rod protein FlgF  52.87 
 
 
246 aa  258  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0922396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1106  flagellar basal body rod protein FlgF  49.6 
 
 
250 aa  248  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  50.2 
 
 
247 aa  240  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2314  flagellar basal body rod protein FlgF  48.98 
 
 
247 aa  237  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.222924 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  48.16 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  48.19 
 
 
249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004169  flagellar basal-body rod protein FlgF  50.2 
 
 
249 aa  234  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  48.98 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  48.16 
 
 
247 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01291  flagellar basal body rod protein FlgF  49.8 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  47.76 
 
 
247 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  47.76 
 
 
247 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  47.76 
 
 
247 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  48.16 
 
 
247 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  46.53 
 
 
247 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  46.94 
 
 
247 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  46.94 
 
 
247 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  46.94 
 
 
247 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  46.53 
 
 
247 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.56 
 
 
247 aa  225  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  48.78 
 
 
247 aa  224  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2374  hypothetical protein  50.41 
 
 
246 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.970288  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  46.53 
 
 
247 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  48.7 
 
 
247 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1221  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.97 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.35 
 
 
247 aa  219  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2334  flagellar basal body rod protein FlgF  47.28 
 
 
241 aa  217  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.83 
 
 
247 aa  217  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0897  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.93 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.68 
 
 
246 aa  211  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  44.18 
 
 
248 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  40.33 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1228  flagellar basal body rod protein FlgF  43.37 
 
 
248 aa  198  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000736  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.56 
 
 
243 aa  197  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  40.4 
 
 
253 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0753  hypothetical protein  41.98 
 
 
247 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  40.4 
 
 
253 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  42.57 
 
 
252 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  40 
 
 
253 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  40.4 
 
 
253 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  40.4 
 
 
253 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  40.4 
 
 
253 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  41.77 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  41.77 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  40 
 
 
253 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  40 
 
 
253 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  41.77 
 
 
252 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  41.77 
 
 
252 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  41.77 
 
 
252 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.98 
 
 
246 aa  192  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  41.37 
 
 
252 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  41.37 
 
 
252 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  41.37 
 
 
252 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  43.04 
 
 
247 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04913  flagellar basal body rod protein  41.39 
 
 
243 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1529  flagellar basal body rod protein  41.37 
 
 
251 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  41.8 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0223  flagellar basal body rod protein FlgF  43.03 
 
 
243 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0643  flagellar basal body rod protein FlgF  43.03 
 
 
243 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.56 
 
 
246 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.21 
 
 
241 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2594  flagellar basal body rod protein FlgF  42.57 
 
 
251 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  41.63 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  42.8 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1267  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.22 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371725  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1470  hypothetical protein  42.91 
 
 
245 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1872  flagellar basal body rod protein FlgF  41.77 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0065  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.91 
 
 
244 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2051  flagellar basal body rod protein FlgF  41.2 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.216259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3967  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.68 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01073  flagellar component of cell-proximal portion of basal-body rod  41.2 
 
 
251 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2569  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.2 
 
 
251 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.893444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1456  flagellar basal body rod protein FlgF  41.2 
 
 
251 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.965329  hitchhiker  0.00040155 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01081  hypothetical protein  41.2 
 
 
251 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1200  flagellar basal body rod protein FlgF  41.2 
 
 
251 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2523  flagellar basal body rod protein FlgF  41.2 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408348  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1591  flagellar basal body rod protein FlgF  39.76 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3464  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.5 
 
 
244 aa  178  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1200  flagellar basal body rod protein FlgF  41.2 
 
 
251 aa  178  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2952  flagellar basal body rod protein FlgF  41.37 
 
 
252 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0346  flagellar basal-body rod protein FlgF  38.93 
 
 
245 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  0.715732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2421  flagellar basal body rod protein FlgF  40.56 
 
 
251 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.778215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2320  flagellar basal body rod protein FlgF  40.56 
 
 
251 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3647  flagellar basal-body rod FlgF  42.11 
 
 
244 aa  174  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1974  flagellar basal-body rod FlgF  40.48 
 
 
253 aa  174  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2248  flagellar basal body rod protein FlgF  40.4 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2966  flagellar basal body rod protein FlgF  40.16 
 
 
251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.754778  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1290  flagellar basal body rod protein FlgF  40.16 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0203171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1246  flagellar basal body rod protein FlgF  40.16 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326138  normal  0.233716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>