More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3947 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3947  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 246 aa  496  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  99.59 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3727  flagellar basal body rod protein FlgF  95.12 
 
 		 248 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  93.9 
 
 		 246 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1501  flagellar basal body rod protein FlgF  85.31 
 
 		 246 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  75.2 
 
 		 246 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  74.8 
 
 		 246 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2846  flagellar basal body rod protein FlgF  74.39 
 
 		 246 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0922396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  70.68 
 
 		 249 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  71.08 
 
 		 249 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2209  flagellar basal body rod protein FlgF  57.89 
 
 		 249 aa  301  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1106  flagellar basal body rod protein FlgF  58.47 
 
 		 250 aa  285  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  56.91 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  55.33 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  54.88 
 
 		 247 aa  269  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  54.07 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  54.25 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  54.07 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  52.85 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  53.25 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  53.25 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  53.66 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  52.85 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  53.66 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  53.66 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  53.66 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  50.41 
 
 		 246 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2314  flagellar basal body rod protein FlgF  52.63 
 
 		 247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.222924 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2374  hypothetical protein  54.47 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.970288  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  52.03 
 
 		 247 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1221  flagellar basal-body rod protein FlgF  51.84 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  50 
 
 		 247 aa  242  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  50 
 
 		 247 aa  242  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  50.2 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  49.8 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.74 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.34 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0753  hypothetical protein  47.35 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004169  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.98 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0897  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.95 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01291  flagellar basal body rod protein FlgF  47.58 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  47.01 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2334  flagellar basal body rod protein FlgF  48.96 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  45.63 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  45.63 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  47.41 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  46.12 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  45.24 
 
 		 253 aa  222  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.74 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.53 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  45.24 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  45.24 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  45.24 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  45.24 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  45.24 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  45.42 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  45.42 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  45.42 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  45.82 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  45.82 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  44.67 
 
 		 247 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  45.8 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  42.63 
 
 		 252 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  41.83 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1325  flagellar basal body rod protein FlgF  45.38 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  43.95 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  41.22 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1470  hypothetical protein  43.09 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.91 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  43.62 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  41.94 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1267  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.68 
 
 		 247 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371725  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0346  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.22 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  0.715732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2952  flagellar basal body rod protein FlgF  44.62 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1529  flagellar basal body rod protein  39.84 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1228  flagellar basal body rod protein FlgF  41.13 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0267  flagellar basal body rod protein FlgF  42.62 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000736  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.77 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3367  flagellar basal body rod protein FlgF  42.62 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0223  flagellar basal body rod protein FlgF  42.21 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2966  flagellar basal body rod protein FlgF  41.43 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.754778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04913  flagellar basal body rod protein  41.63 
 
 		 243 aa  185  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.82 
 
 		 241 aa  185  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0643  flagellar basal body rod protein FlgF  42.21 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24040  flagellar basal-body rod protein  41 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.11 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3831  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.11 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212792  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2421  flagellar basal body rod protein FlgF  40.56 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.778215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2320  flagellar basal body rod protein FlgF  40.56 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0210  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.39 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1974  flagellar basal-body rod FlgF  40.66 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3967  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.67 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  40.89 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0065  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.68 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3647  flagellar basal-body rod FlgF  42.68 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3710  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.63 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.414142 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4787  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.63 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2594  flagellar basal body rod protein FlgF  38.49 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0629  flagellar basal-body rod protein FlgF  38.87 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>