More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4195 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 248 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  60.16 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  60.57 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  55.95 
 
 		 252 aa  275  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  55.95 
 
 		 252 aa  274  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  55.73 
 
 		 253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  55.73 
 
 		 253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  55.95 
 
 		 252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  55.73 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  55.34 
 
 		 253 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  55.34 
 
 		 253 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  55.34 
 
 		 253 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  55.34 
 
 		 253 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  55.34 
 
 		 253 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  55.16 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  55.56 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  55.16 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  55.16 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  54.76 
 
 		 252 aa  271  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  54.76 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2966  flagellar basal body rod protein FlgF  54.72 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.754778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  52.85 
 
 		 246 aa  258  8e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2952  flagellar basal body rod protein FlgF  58.33 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2594  flagellar basal body rod protein FlgF  52.57 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1529  flagellar basal body rod protein  53.36 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1872  flagellar basal body rod protein FlgF  51.78 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1325  flagellar basal body rod protein FlgF  53.6 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24040  flagellar basal-body rod protein  54.98 
 
 		 251 aa  244  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2421  flagellar basal body rod protein FlgF  51.78 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.778215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2320  flagellar basal body rod protein FlgF  51.78 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1591  flagellar basal body rod protein FlgF  52.59 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0753  hypothetical protein  52.4 
 
 		 247 aa  242  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  54.07 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2523  flagellar basal body rod protein FlgF  52.99 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408348  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2051  flagellar basal body rod protein FlgF  52.99 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01073  flagellar component of cell-proximal portion of basal-body rod  52.99 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2569  flagellar basal-body rod protein FlgF  52.99 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.893444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1275  flagellar basal body rod protein FlgF  52.57 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.658738  hitchhiker  0.00859374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1246  flagellar basal body rod protein FlgF  52.57 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326138  normal  0.233716 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01081  hypothetical protein  52.99 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1456  flagellar basal body rod protein FlgF  52.99 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.965329  hitchhiker  0.00040155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1290  flagellar basal body rod protein FlgF  52.57 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0203171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2194  flagellar basal body rod protein FlgF  52.57 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000311008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2010  flagellar basal body rod protein FlgF  52.57 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1200  flagellar basal body rod protein FlgF  52.59 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1200  flagellar basal body rod protein FlgF  52.59 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1974  flagellar basal-body rod FlgF  51.39 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2248  flagellar basal body rod protein FlgF  52.59 
 
 		 251 aa  235  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777669  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0346  flagellar basal-body rod protein FlgF  50.61 
 
 		 245 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  0.715732 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  50.61 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1557  flagellar basal body rod protein  48.21 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  52.03 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  51.02 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.75 
 
 		 247 aa  225  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  50.4 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0897  flagellar basal-body rod protein FlgF  49.39 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1221  flagellar basal-body rod protein FlgF  50.61 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  48.58 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  48.58 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  48.58 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  47.56 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  48.99 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  48.58 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  48.18 
 
 		 247 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3710  flagellar basal-body rod protein FlgF  50.61 
 
 		 245 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.414142 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4787  flagellar basal-body rod protein FlgF  50.61 
 
 		 245 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  47.56 
 
 		 247 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2374  hypothetical protein  48.19 
 
 		 246 aa  215  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.970288  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.16 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  48.58 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  47.77 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  47.56 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  47.56 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2314  flagellar basal body rod protein FlgF  46.99 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.222924 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  47.77 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  44.35 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.58 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  49.39 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  46.96 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.96 
 
 		 247 aa  208  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2209  flagellar basal body rod protein FlgF  42.04 
 
 		 249 aa  208  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  43.55 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2846  flagellar basal body rod protein FlgF  45.31 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0922396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  43.95 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  44.58 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3947  flagellar basal body rod protein FlgF  43.95 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3727  flagellar basal body rod protein FlgF  43.55 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.72 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1106  flagellar basal body rod protein FlgF  43.95 
 
 		 250 aa  198  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  46.96 
 
 		 246 aa  194  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  42.11 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  42.11 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.8 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3831  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.8 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212792  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1501  flagellar basal body rod protein FlgF  41.22 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0629  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.35 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.63 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2002  flagellar basal body rod protein FlgF  50.82 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004169  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.51 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>