More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1601 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 247 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  89.88 
 
 		 247 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  89.88 
 
 		 247 aa  454  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  84.62 
 
 		 247 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  84.21 
 
 		 247 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  83.81 
 
 		 247 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  84.21 
 
 		 247 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  82.19 
 
 		 247 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  82.59 
 
 		 247 aa  421  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  83 
 
 		 247 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  82.19 
 
 		 247 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  82.19 
 
 		 247 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  82.19 
 
 		 247 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2314  flagellar basal body rod protein FlgF  75.61 
 
 		 247 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.222924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  76.02 
 
 		 247 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  75.3 
 
 		 247 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  58.13 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  57.72 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01291  flagellar basal body rod protein FlgF  58.23 
 
 		 249 aa  295  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004169  flagellar basal-body rod protein FlgF  57.43 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  60.41 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  59.44 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2334  flagellar basal body rod protein FlgF  58.75 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3947  flagellar basal body rod protein FlgF  54.88 
 
 		 246 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  54.47 
 
 		 246 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  54.88 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  54.07 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2846  flagellar basal body rod protein FlgF  53.85 
 
 		 246 aa  264  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0922396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3727  flagellar basal body rod protein FlgF  53.25 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  52.85 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1501  flagellar basal body rod protein FlgF  52.23 
 
 		 246 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1221  flagellar basal-body rod protein FlgF  53.04 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  53.2 
 
 		 249 aa  258  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  52.8 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2209  flagellar basal body rod protein FlgF  52 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2374  hypothetical protein  51.22 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.970288  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  50 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  47.37 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1106  flagellar basal body rod protein FlgF  47.79 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0753  hypothetical protein  48.58 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.94 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.97 
 
 		 247 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  44.94 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  48.99 
 
 		 248 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.08 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.9 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1325  flagellar basal body rod protein FlgF  46.8 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  44.27 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  44.27 
 
 		 252 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  43.48 
 
 		 252 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0897  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.75 
 
 		 246 aa  211  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  43.08 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  43.08 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0346  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.72 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  0.715732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  43.48 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  42.69 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  42.69 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  42.69 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  43.67 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  44.49 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  44.13 
 
 		 242 aa  205  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04913  flagellar basal body rod protein  45.08 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.94 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3464  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.97 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0065  flagellar basal-body rod protein FlgF  48.18 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1267  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.53 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000736  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.26 
 
 		 243 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  42.13 
 
 		 253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  42.13 
 
 		 253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3647  flagellar basal-body rod FlgF  46.56 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3967  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.56 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  42.13 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  41.73 
 
 		 253 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  41.73 
 
 		 253 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  41.73 
 
 		 253 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  41.73 
 
 		 253 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  41.73 
 
 		 253 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24040  flagellar basal-body rod protein  42.23 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2952  flagellar basal body rod protein FlgF  45.06 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0071  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.9 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.15 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.37 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3831  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.37 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212792  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4675  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.67 
 
 		 241 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0210  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.04 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3710  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.9 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.414142 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4787  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.9 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2911  flagellar basal-body rod FlgF  39.84 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0223  flagellar basal body rod protein FlgF  42.45 
 
 		 243 aa  184  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1200  flagellar basal body rod protein FlgF  41.5 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1529  flagellar basal body rod protein  38.74 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2966  flagellar basal body rod protein FlgF  41.11 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.754778  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01073  flagellar component of cell-proximal portion of basal-body rod  41.11 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2569  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.11 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.893444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2523  flagellar basal body rod protein FlgF  41.5 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408348  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2051  flagellar basal body rod protein FlgF  41.11 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216259 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3367  flagellar basal body rod protein FlgF  42.86 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01081  hypothetical protein  41.11 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1456  flagellar basal body rod protein FlgF  41.11 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.965329  hitchhiker  0.00040155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>