More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3647 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3647  flagellar basal-body rod FlgF  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3464  flagellar basal-body rod protein FlgF  76.13 
 
 		 244 aa  374  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3967  flagellar basal-body rod protein FlgF  74.49 
 
 		 244 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0065  flagellar basal-body rod protein FlgF  70.08 
 
 		 244 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0071  flagellar basal-body rod protein FlgF  66.8 
 
 		 241 aa  325  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0223  flagellar basal body rod protein FlgF  50 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0643  flagellar basal body rod protein FlgF  48.77 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04913  flagellar basal body rod protein  47.11 
 
 		 243 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000736  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.69 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4675  flagellar basal-body rod protein FlgF  48.35 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0210  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.41 
 
 		 243 aa  208  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0188  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.28 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.866674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  46.56 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  46.56 
 
 		 247 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0241  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.45 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  46.56 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  46.56 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  46.56 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  46.15 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  45.34 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  45.75 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2314  flagellar basal body rod protein FlgF  46.15 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.222924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  44.94 
 
 		 247 aa  188  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  44.53 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  44.76 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.56 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  44.53 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.56 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  44.13 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  44.13 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3367  flagellar basal body rod protein FlgF  42.68 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3574  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.03 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2846  flagellar basal body rod protein FlgF  43.9 
 
 		 246 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0922396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0267  flagellar basal body rod protein FlgF  41.87 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2209  flagellar basal body rod protein FlgF  43.32 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3727  flagellar basal body rod protein FlgF  43.9 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  44.31 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.09 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  42.68 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  42.68 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  44.58 
 
 		 249 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3947  flagellar basal body rod protein FlgF  42.68 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1974  flagellar basal-body rod FlgF  40.8 
 
 		 253 aa  174  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  44.58 
 
 		 249 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.11 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.86 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  43.32 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.11 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1106  flagellar basal body rod protein FlgF  43.43 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1501  flagellar basal body rod protein FlgF  41.06 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  40.93 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1221  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.09 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  38.8 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  38.62 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  38.8 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1591  flagellar basal body rod protein FlgF  38.65 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  38.65 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  38.25 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  38.25 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  38.25 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  38.25 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  38.25 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  42.8 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01073  flagellar component of cell-proximal portion of basal-body rod  39.92 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2569  flagellar basal-body rod protein FlgF  39.92 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.893444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01081  hypothetical protein  39.92 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0753  hypothetical protein  39.18 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  38.55 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2051  flagellar basal body rod protein FlgF  39.92 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2966  flagellar basal body rod protein FlgF  39.2 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.754778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2523  flagellar basal body rod protein FlgF  39.53 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408348  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.32 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1200  flagellar basal body rod protein FlgF  39.53 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1557  flagellar basal body rod protein  37.6 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  41.2 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1456  flagellar basal body rod protein FlgF  39.92 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.965329  hitchhiker  0.00040155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  41.91 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1200  flagellar basal body rod protein FlgF  39.53 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1290  flagellar basal body rod protein FlgF  38 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0203171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2194  flagellar basal body rod protein FlgF  38 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000311008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1275  flagellar basal body rod protein FlgF  38 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.658738  hitchhiker  0.00859374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1246  flagellar basal body rod protein FlgF  38 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326138  normal  0.233716 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  38.55 
 
 		 252 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  38.65 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0346  flagellar basal-body rod protein FlgF  37.65 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  0.715732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2010  flagellar basal body rod protein FlgF  37.6 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1529  flagellar basal body rod protein  37.05 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  37.45 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  37.45 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  37.45 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  37.45 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.03 
 
 		 241 aa  154  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  38.55 
 
 		 247 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0897  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.8 
 
 		 246 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2248  flagellar basal body rod protein FlgF  39.13 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777669  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1872  flagellar basal body rod protein FlgF  38 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  37.45 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  37.45 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2594  flagellar basal body rod protein FlgF  38 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  39.27 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>