More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2846 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2846  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0922396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  79.92 
 
 		 249 aa  407  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  79.52 
 
 		 249 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  73.98 
 
 		 246 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3947  flagellar basal body rod protein FlgF  74.39 
 
 		 246 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  73.17 
 
 		 246 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  70.61 
 
 		 246 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3727  flagellar basal body rod protein FlgF  72.36 
 
 		 248 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  70.2 
 
 		 246 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1501  flagellar basal body rod protein FlgF  72.87 
 
 		 246 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2209  flagellar basal body rod protein FlgF  56.45 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1106  flagellar basal body rod protein FlgF  56.45 
 
 		 250 aa  285  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  55.47 
 
 		 247 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  54.47 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  53.85 
 
 		 247 aa  264  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  55.24 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  55.65 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  55.65 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1221  flagellar basal-body rod protein FlgF  52.85 
 
 		 246 aa  261  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  54.25 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  52.63 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  54.25 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  54.25 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  54.25 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  55.24 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  52.87 
 
 		 247 aa  258  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2374  hypothetical protein  54.29 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.970288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2314  flagellar basal body rod protein FlgF  53.25 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.222924 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  52.23 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  53.04 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  51.01 
 
 		 247 aa  248  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  50.2 
 
 		 247 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  48.98 
 
 		 246 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  51 
 
 		 249 aa  238  8e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  48.98 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004169  flagellar basal-body rod protein FlgF  51.6 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  45.93 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0897  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.97 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1325  flagellar basal body rod protein FlgF  48.81 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01291  flagellar basal body rod protein FlgF  49.6 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.37 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2334  flagellar basal body rod protein FlgF  50.83 
 
 		 241 aa  224  9e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.34 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0753  hypothetical protein  44.31 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.72 
 
 		 246 aa  218  7e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  47.03 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.08 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  43.08 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  43.08 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  43.48 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  44.92 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  42.69 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  42.69 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  42.69 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  42.69 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  42.69 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  44.05 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  44.44 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  43.25 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  43.65 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  45.31 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  41.06 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  42.06 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  42.06 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  42.06 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  41.18 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  40.39 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1470  hypothetical protein  44.13 
 
 		 245 aa  199  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0223  flagellar basal body rod protein FlgF  45.08 
 
 		 243 aa  195  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0346  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.41 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  0.715732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  41.06 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  41.94 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0643  flagellar basal body rod protein FlgF  44.26 
 
 		 243 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.2 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0210  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.13 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01073  flagellar component of cell-proximal portion of basal-body rod  41.5 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2569  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.5 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.893444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2523  flagellar basal body rod protein FlgF  41.5 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408348  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1456  flagellar basal body rod protein FlgF  41.5 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.965329  hitchhiker  0.00040155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2051  flagellar basal body rod protein FlgF  41.5 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.46 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01081  hypothetical protein  41.5 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24040  flagellar basal-body rod protein  41.32 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1200  flagellar basal body rod protein FlgF  41.5 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1200  flagellar basal body rod protein FlgF  41.5 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3967  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.9 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1228  flagellar basal body rod protein FlgF  40.32 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3647  flagellar basal-body rod FlgF  43.9 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2248  flagellar basal body rod protein FlgF  41.11 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777669  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000736  flagellar basal-body rod protein FlgF  39.34 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1529  flagellar basal body rod protein  39.53 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2952  flagellar basal body rod protein FlgF  42.06 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4675  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.62 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039193 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04913  flagellar basal body rod protein  39.75 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3464  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.08 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2594  flagellar basal body rod protein FlgF  38.15 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1872  flagellar basal body rod protein FlgF  37.75 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3710  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.82 
 
 		 245 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.414142 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4787  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.82 
 
 		 245 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>