More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1772 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  100 
 
 		 247 aa  495  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0897  flagellar basal-body rod protein FlgF  53.44 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2209  flagellar basal body rod protein FlgF  52.02 
 
 		 249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  52.44 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1221  flagellar basal-body rod protein FlgF  53.04 
 
 		 246 aa  252  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  50.6 
 
 		 249 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2846  flagellar basal body rod protein FlgF  51.01 
 
 		 246 aa  248  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0922396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  50.2 
 
 		 249 aa  248  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  52.05 
 
 		 246 aa  245  6e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2374  hypothetical protein  54.47 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.970288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3947  flagellar basal body rod protein FlgF  50 
 
 		 246 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  50 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  49.59 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0753  hypothetical protein  51.42 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3727  flagellar basal body rod protein FlgF  49.59 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  49.59 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  49.59 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  50.82 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1106  flagellar basal body rod protein FlgF  48.59 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  49.21 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  45.75 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  49.21 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  47.58 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  47.58 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  49.21 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  48.82 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  48.82 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1501  flagellar basal body rod protein FlgF  46.15 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  48.82 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  48.82 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  48.82 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  47.18 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  47.76 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  47.18 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  47.18 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  47.98 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  47.98 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  48.18 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  47.18 
 
 		 247 aa  221  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  47.58 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  45.97 
 
 		 247 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2314  flagellar basal body rod protein FlgF  46.96 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.222924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  46.77 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.35 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  46.56 
 
 		 246 aa  219  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  48.78 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  47.83 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1325  flagellar basal body rod protein FlgF  45.6 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  47.43 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  47.83 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  46.77 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  47.18 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  47.43 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  45.56 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  49.19 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  45.24 
 
 		 246 aa  215  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.75 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  48 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004169  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.6 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  46.64 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  46.64 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  47.98 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  46.64 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24040  flagellar basal-body rod protein  46 
 
 		 251 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2966  flagellar basal body rod protein FlgF  47.83 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.754778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  45.85 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01291  flagellar basal body rod protein FlgF  46 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  45.45 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1974  flagellar basal-body rod FlgF  46.03 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1470  hypothetical protein  46.37 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2320  flagellar basal body rod protein FlgF  44.66 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2421  flagellar basal body rod protein FlgF  44.66 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.778215  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2334  flagellar basal body rod protein FlgF  46.67 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0346  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.32 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  0.715732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.51 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  44.18 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01073  flagellar component of cell-proximal portion of basal-body rod  44.84 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01081  hypothetical protein  44.84 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2569  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.84 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.893444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1456  flagellar basal body rod protein FlgF  44.84 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.965329  hitchhiker  0.00040155 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1200  flagellar basal body rod protein FlgF  44.44 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1200  flagellar basal body rod protein FlgF  44.05 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2952  flagellar basal body rod protein FlgF  47.43 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.13 
 
 		 241 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.34 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2051  flagellar basal body rod protein FlgF  44.44 
 
 		 251 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216259 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2523  flagellar basal body rod protein FlgF  44.05 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408348  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2911  flagellar basal-body rod FlgF  41.87 
 
 		 247 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2248  flagellar basal body rod protein FlgF  44.44 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777669  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1246  flagellar basal body rod protein FlgF  44.05 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326138  normal  0.233716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1228  flagellar basal body rod protein FlgF  44.18 
 
 		 248 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1290  flagellar basal body rod protein FlgF  44.05 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0203171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1902  flagellar basal body rod protein FlgF  45.6 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101684 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3367  flagellar basal body rod protein FlgF  44.53 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1275  flagellar basal body rod protein FlgF  44.05 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.658738  hitchhiker  0.00859374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0267  flagellar basal body rod protein FlgF  44.53 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2194  flagellar basal body rod protein FlgF  44.05 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000311008 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0643  flagellar basal body rod protein FlgF  43.72 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0210  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.53 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2010  flagellar basal body rod protein FlgF  43.65 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>