More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1307 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 247 aa  500  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  77.64 
 
 		 247 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  78.05 
 
 		 247 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  78.05 
 
 		 247 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  78.05 
 
 		 247 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  77.64 
 
 		 247 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  77.64 
 
 		 247 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  77.24 
 
 		 247 aa  401  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  76.83 
 
 		 247 aa  401  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  76.42 
 
 		 247 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  78.46 
 
 		 247 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  76.42 
 
 		 247 aa  391  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  77.64 
 
 		 247 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  76.02 
 
 		 247 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  74.8 
 
 		 247 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2314  flagellar basal body rod protein FlgF  71.26 
 
 		 247 aa  377  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.222924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  59.59 
 
 		 247 aa  299  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  56.68 
 
 		 249 aa  284  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  53.25 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01291  flagellar basal body rod protein FlgF  56.85 
 
 		 249 aa  278  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  53.25 
 
 		 247 aa  278  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  55.87 
 
 		 246 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  55.47 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004169  flagellar basal-body rod protein FlgF  54.84 
 
 		 249 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2334  flagellar basal body rod protein FlgF  58.09 
 
 		 241 aa  272  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2846  flagellar basal body rod protein FlgF  54.47 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0922396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3947  flagellar basal body rod protein FlgF  54.25 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  53.85 
 
 		 246 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3727  flagellar basal body rod protein FlgF  53.44 
 
 		 248 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  51.82 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  52.21 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  52.21 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1221  flagellar basal-body rod protein FlgF  52.85 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2209  flagellar basal body rod protein FlgF  50.6 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1501  flagellar basal body rod protein FlgF  50.41 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  48.58 
 
 		 246 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2374  hypothetical protein  51.01 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.970288  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  46.75 
 
 		 246 aa  238  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1106  flagellar basal body rod protein FlgF  49 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  48.16 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  48.18 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.9 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0753  hypothetical protein  45.53 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.67 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0897  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.9 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  44.49 
 
 		 247 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  42.86 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  41.27 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  41.27 
 
 		 252 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  43.25 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1325  flagellar basal body rod protein FlgF  44.58 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  42.86 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  42.86 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  42.86 
 
 		 247 aa  204  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  41.11 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  41.11 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  44.58 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  40.71 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  40.71 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  41.67 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  40.71 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  40.71 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  40.71 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1267  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.32 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  40.71 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  41.67 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  41.67 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  42.68 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0223  flagellar basal body rod protein FlgF  45.53 
 
 		 243 aa  194  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  40.6 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0643  flagellar basal body rod protein FlgF  45.53 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.87 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24040  flagellar basal-body rod protein  40.64 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2911  flagellar basal-body rod FlgF  39.43 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3464  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.75 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000736  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.16 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3647  flagellar basal-body rod FlgF  44.76 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2966  flagellar basal body rod protein FlgF  40.48 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.754778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1470  hypothetical protein  44.53 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2952  flagellar basal body rod protein FlgF  41.27 
 
 		 252 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04913  flagellar basal body rod protein  40.98 
 
 		 243 aa  185  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1974  flagellar basal-body rod FlgF  40.71 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4675  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.9 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3967  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.72 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.13 
 
 		 246 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1529  flagellar basal body rod protein  37.3 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0346  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.24 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  0.715732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1591  flagellar basal body rod protein FlgF  39.42 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0210  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.28 
 
 		 243 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.96 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3831  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.96 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212792  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1872  flagellar basal body rod protein FlgF  38.34 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0065  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.76 
 
 		 244 aa  178  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01073  flagellar component of cell-proximal portion of basal-body rod  40.25 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2569  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.25 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.893444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1200  flagellar basal body rod protein FlgF  39.83 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01081  hypothetical protein  40.25 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1456  flagellar basal body rod protein FlgF  40.25 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.965329  hitchhiker  0.00040155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2051  flagellar basal body rod protein FlgF  40.25 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216259 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2523  flagellar basal body rod protein FlgF  39.83 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408348  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>