More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2334 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2334  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01291  flagellar basal body rod protein FlgF  79.17 
 
 		 249 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  79.5 
 
 		 249 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004169  flagellar basal-body rod protein FlgF  78.75 
 
 		 249 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  61.25 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  61.25 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  59.58 
 
 		 247 aa  284  8e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  60.67 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2314  flagellar basal body rod protein FlgF  58.51 
 
 		 247 aa  277  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.222924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  58.75 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  59.58 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  59.17 
 
 		 247 aa  274  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  59.17 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  59.17 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  57.92 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  58.09 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  57.92 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  57.08 
 
 		 247 aa  268  8e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  57.5 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  57.5 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  57.08 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  50.63 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  50.63 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  50.62 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  49.79 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2209  flagellar basal body rod protein FlgF  48.55 
 
 		 249 aa  228  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  48.55 
 
 		 246 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3947  flagellar basal body rod protein FlgF  48.96 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2846  flagellar basal body rod protein FlgF  50.83 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0922396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  48.55 
 
 		 246 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3727  flagellar basal body rod protein FlgF  48.55 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1106  flagellar basal body rod protein FlgF  47.33 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3579  flagellar basal-body rod protein FlgF  47.28 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  48.15 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  48.15 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1501  flagellar basal body rod protein FlgF  46.67 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2374  hypothetical protein  48.55 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.970288  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0897  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.44 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  46.67 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1221  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.08 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  42.5 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.23 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.12 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  41.06 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  41.46 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  42.68 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  41.87 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  41.87 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  41.87 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  41.46 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  41.46 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  41.46 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0753  hypothetical protein  43.98 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  40.49 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  40.49 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  40.49 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  40.08 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  40.08 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  40.08 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  40.08 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  40.08 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  41.67 
 
 		 246 aa  174  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  39.09 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1902  flagellar basal body rod protein FlgF  38.17 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1267  flagellar basal-body rod protein FlgF  39.83 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1591  flagellar basal body rod protein FlgF  39.59 
 
 		 251 aa  168  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2248  flagellar basal body rod protein FlgF  40 
 
 		 251 aa  168  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777669  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  38.24 
 
 		 247 aa  168  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1200  flagellar basal body rod protein FlgF  40 
 
 		 251 aa  167  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01073  flagellar component of cell-proximal portion of basal-body rod  40 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2569  flagellar basal-body rod protein FlgF  40 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.893444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01081  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2523  flagellar basal body rod protein FlgF  40 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408348  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1456  flagellar basal body rod protein FlgF  40 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.965329  hitchhiker  0.00040155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2051  flagellar basal body rod protein FlgF  40 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216259 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1470  hypothetical protein  40.42 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4195  flagellar basal body rod protein FlgF  40.91 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1228  flagellar basal body rod protein FlgF  37.04 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1200  flagellar basal body rod protein FlgF  39.59 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24040  flagellar basal-body rod protein  38.78 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2952  flagellar basal body rod protein FlgF  39.84 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1872  flagellar basal body rod protein FlgF  37.4 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2594  flagellar basal body rod protein FlgF  37.4 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  38.24 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2730  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.25 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2966  flagellar basal body rod protein FlgF  39.18 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.754778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  42.08 
 
 		 242 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2194  flagellar basal body rod protein FlgF  39.59 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000311008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1275  flagellar basal body rod protein FlgF  39.59 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.658738  hitchhiker  0.00859374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1246  flagellar basal body rod protein FlgF  39.59 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326138  normal  0.233716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1290  flagellar basal body rod protein FlgF  39.59 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0203171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0210  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.59 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04913  flagellar basal body rod protein  39.66 
 
 		 243 aa  158  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01008  flagellar basal body rod protein FlgF  38.6 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06158  flagellar basal body rod protein FlgF  38.6 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00145829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  38.24 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2010  flagellar basal body rod protein FlgF  39.18 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0223  flagellar basal body rod protein FlgF  40.59 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1529  flagellar basal body rod protein  37.55 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0643  flagellar basal body rod protein FlgF  40.83 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>