More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06158 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_06158  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00145829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01008  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1902  flagellar basal body rod protein FlgF  68.42 
 
 
249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.101684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24040  flagellar basal-body rod protein  43.97 
 
 
251 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1221  flagellar basal-body rod protein FlgF  45.22 
 
 
246 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0930  flagellar basal-body rod protein FlgF  44.05 
 
 
246 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1591  flagellar basal body rod protein FlgF  44.49 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2374  hypothetical protein  44.29 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.970288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1788  flagellar basal body rod protein FlgF  41.48 
 
 
249 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1557  flagellar basal body rod protein  42.79 
 
 
251 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2920  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.48 
 
 
246 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01291  flagellar basal body rod protein FlgF  39.3 
 
 
249 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2421  flagellar basal body rod protein FlgF  43.72 
 
 
251 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.778215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2320  flagellar basal body rod protein FlgF  43.72 
 
 
251 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1633  flagellar basal body rod protein FlgF  40.77 
 
 
246 aa  168  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.655362  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2209  flagellar basal body rod protein FlgF  40.87 
 
 
249 aa  168  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0897  flagellar basal-body rod protein FlgF  43.42 
 
 
246 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004169  flagellar basal-body rod protein FlgF  39.3 
 
 
249 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1974  flagellar basal-body rod FlgF  43.1 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0753  hypothetical protein  40.79 
 
 
247 aa  165  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5629  flagellar basal body rod protein FlgF  43.36 
 
 
247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2966  flagellar basal body rod protein FlgF  42.86 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.754778  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1200  flagellar basal body rod protein FlgF  41.99 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1772  flagellar basal-body rod protein FlgF  42.54 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2051  flagellar basal body rod protein FlgF  41.99 
 
 
251 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.216259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2010  flagellar basal body rod protein FlgF  42.42 
 
 
251 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01073  flagellar component of cell-proximal portion of basal-body rod  41.99 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2569  flagellar basal-body rod protein FlgF  41.99 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.893444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01081  hypothetical protein  41.99 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1275  flagellar basal body rod protein FlgF  42.42 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.658738  hitchhiker  0.00859374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2194  flagellar basal body rod protein FlgF  42.42 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000311008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1246  flagellar basal body rod protein FlgF  42.42 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326138  normal  0.233716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1290  flagellar basal body rod protein FlgF  42.42 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0203171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2523  flagellar basal body rod protein FlgF  41.56 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408348  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1200  flagellar basal body rod protein FlgF  41.56 
 
 
251 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1456  flagellar basal body rod protein FlgF  41.99 
 
 
251 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.965329  hitchhiker  0.00040155 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2248  flagellar basal body rod protein FlgF  41.99 
 
 
251 aa  161  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3040  flagellar basal body rod protein FlgF  42.13 
 
 
252 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1872  flagellar basal body rod protein FlgF  40.79 
 
 
251 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0144  flagellar basal body rod protein FlgF  41.7 
 
 
252 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2407  flagellar basal body rod protein FlgF  42.13 
 
 
252 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3021  flagellar basal body rod protein FlgF  42.13 
 
 
252 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2594  flagellar basal body rod protein FlgF  40.35 
 
 
251 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  39.3 
 
 
247 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1529  flagellar basal body rod protein  40.09 
 
 
251 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6367  flagellar basal body rod protein FlgF  42.98 
 
 
252 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.935406  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  39.74 
 
 
247 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  39.74 
 
 
247 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3016  flagellar basal body rod protein FlgF  42.55 
 
 
252 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1325  flagellar basal body rod protein FlgF  41.2 
 
 
250 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0244  flagellar basal body rod protein FlgF  41.95 
 
 
253 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2931  flagellar basal body rod protein FlgF  42.13 
 
 
252 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3831  flagellar basal-body rod protein FlgF  39.83 
 
 
246 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212792  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3104  flagellar basal-body rod protein FlgF  39.83 
 
 
246 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0998902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0282  flagellar basal body rod protein FlgF  41.53 
 
 
253 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0466  flagellar basal body rod protein FlgF  41.53 
 
 
253 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2334  flagellar basal body rod protein FlgF  38.6 
 
 
241 aa  158  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  39.3 
 
 
247 aa  158  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2998  flagellar basal body rod protein FlgF  41.53 
 
 
253 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2095  flagellar basal body rod protein FlgF  41.53 
 
 
253 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3329  flagellar basal body rod protein FlgF  41.53 
 
 
253 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0270  flagellar basal body rod protein FlgF  41.53 
 
 
253 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379384  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3350  flagellar basal body rod protein FlgF  41.53 
 
 
253 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3066  flagellar basal body rod protein FlgF  42.13 
 
 
252 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2846  flagellar basal body rod protein FlgF  38.6 
 
 
246 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0922396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3790  flagellar basal body rod protein FlgF  41.25 
 
 
252 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3738  flagellar basal body rod protein FlgF  43.17 
 
 
247 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1939  flagellar basal-body rod protein FlgF  39.65 
 
 
246 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1469  flagellar basal body rod protein FlgF  42.01 
 
 
246 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839751  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  38.96 
 
 
247 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3476  flagellar basal body rod protein FlgF  39.21 
 
 
246 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  38.03 
 
 
247 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50440  flagellar basal body rod protein FlgF  35.96 
 
 
249 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523521 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  37.18 
 
 
247 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4296  flagellar basal body rod protein FlgF  35.81 
 
 
249 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  38.6 
 
 
247 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  38.86 
 
 
247 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  38.43 
 
 
247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0629  flagellar basal-body rod protein FlgF  38.1 
 
 
246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3727  flagellar basal body rod protein FlgF  41.55 
 
 
248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  38.43 
 
 
247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.827797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  37.61 
 
 
247 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  40.61 
 
 
246 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  37.72 
 
 
246 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  38.43 
 
 
247 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1106  flagellar basal body rod protein FlgF  38.2 
 
 
250 aa  151  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  38.6 
 
 
247 aa  151  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  38.16 
 
 
247 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4386  flagellar basal body rod protein FlgF  38.33 
 
 
246 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3947  flagellar basal body rod protein FlgF  38.33 
 
 
246 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  37.55 
 
 
247 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1228  flagellar basal body rod protein FlgF  39.22 
 
 
248 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  39.83 
 
 
248 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  40.26 
 
 
246 aa  148  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1267  flagellar basal-body rod protein FlgF  37.93 
 
 
247 aa  148  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371725  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0643  flagellar basal body rod protein FlgF  38.94 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4424  Fis family transcriptional regulator  38.1 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0223  flagellar basal body rod protein FlgF  39.38 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1470  hypothetical protein  36.82 
 
 
245 aa  146  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0516  flagellar basal-body rod protein FlgF  37.55 
 
 
246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>